Page 30 - 南京医科大学学报自然科学版
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第42卷第12期
·1666 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2022年12月
天生物公司);Lac 测定试剂盒(南京建成公司); 3.7 mg/mL);④ HMGB1 lys88 Ab 组(15 mmol/L Lac +
lys88 lys114 Ab 组
BCA 蛋白定量试剂盒(Biosharp 公司,中国);NF⁃κB HMGB1 Ab 3.8 mg/mL) ;⑤ HMGB1
(AF5006)兔单抗、羊抗兔多克隆 IgG(#S0001)(Af⁃ (15 mmol/L Lac+HMGB1 lys114 Ab 1.6 mg/mL);⑥TNF⁃
finity Biosciences公司,美国)。 α组(15 mmol/L Lac +50 ng/mL TNF⁃α)。置于37 ℃、
1.2 方法 5%CO2培养箱内培养 24 h 后收集细胞蛋白或 RNA
1.2.1 16S rDNA测序 进行下一步实验。
取 40~70 mg 肿瘤组织,CTAB 法提取总 DNA 后 1.2.4 细菌感染MC38细胞模型
用 Qubit 检查基因组 DNA 的质量和浓度。对 16 S 用RPMI完全培养基培养MC38细胞,根据细胞
rRNA 基因的可变区 V2、V3、V5、V6、V8 进行多重扩 数量,调整细菌与MC38细胞之比为感染复数=100∶
增,在 Illumina Novaseq 6000 平台进行测序,最后使 1,在 37 ℃、5%CO2培养箱内,E.coli 与 MC38 细胞共
用QIME软件处理测序数据。 培养。
1.2.2 小鼠CRLM模型建立及分组 1.2.5 CCK8实验
取 6~8 周雄性 C57BL/6 小鼠,麻醉后行左上腹 将MC38细胞接种于96孔板上,每孔加入100 μL
横行切口,打开腹腔,于腹外侧游离并显露脾脏, 细胞悬液(细胞数约 5×10 个)。按上述建立 E.coli
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用 1 mL 注射器从脾下极平行进针约 3 mm,注入 感染 MC38 细胞共培养模型为实验组,以无细菌感
MC38 肿瘤细胞悬液至脾被膜下,肿瘤细胞悬液浓 染 MC38 细胞为对照组,每组设立 5 个复孔,每孔加
度为 1×10 个/mL,每只注入 0.1 mL,见注射部位脾 入 10 μL CCK8 检测液,孵育 2 h,酶标仪在 450 nm
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被膜发白肿胀后拔出针头,压迫止血 2 min,逐层关 处检测吸光值。
腹。共分为 5 组:①对照组(Con 组);②抗生素组 1.2.6 细胞外酸化率(extracellular acidification rate,
(Abx组):将抗生素复合物(氨苄青霉素 1 g/L,万古 ECAR)
霉素 500 mg/L,新霉素 1 g/L,甲硝唑1 g/L)放入小鼠 将上述共培养细胞制成细胞悬液,每孔接种80
饮用水中混匀,持续饮用至建模结束;③E.coli组:建 μL(细胞数约1×10 个)至Seahorse专用96孔板。室
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模第11~15天抗生素处理(同上)后,第19~21天E.coli 温静置1 h,放入培养箱继续培养23 h。分别向探针
(1×10 CFU/mL)100 μL 灌胃;LDHi 组:④第 7 天开 板 A、B 和 C 孔加入葡萄糖、寡霉素和 2⁃脱氧核糖各
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始按照 6 mg/kg 予以灌胃,持续至建模结束;⑤ 25 μL,校正探针板后,加入细胞培养板检测。
Clod⁃Lip4组:建模前1 d腹腔注射200 μL,后间隔3 d 1.2.7 Lac浓度的测定
给药,直至建模结束。第 24 天处死小鼠,收集肝脏 将肿瘤组织制备成组织匀浆,按照说明书配置
组织,每个实验组的样本量为 5。计算肝表面转移 酶工作液、显色剂。依次在酶标板上加入样本、酶
结节体积[用直尺测量肿瘤的长径和短径(cm),代入 工作液、显色剂,37 ℃孵育10 min,随后加入终止剂
公式计算肿瘤体积:V(cm)=0.5×长径×短径 ],并将 终止反应。取反应液 250 μL,设置酶标仪波长
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转移肝组织做病理切片及HE染色。 530 nm,读数。
1.2.3 骨髓来源巨噬细胞(bone marrow derived mac⁃ 1.2.8 组织病理学分析
rophages,BMDM)培养及分组 切除肝脏组织后,将其固定在10%的福尔马林
脱颈处死小鼠,分离股骨和胫骨。剥除骨骼上附 缓冲液中,随后包埋在石蜡中。肝肿瘤组织切片用
着组织,用DMEM完全培养基将骨髓冲入50 mL离心 HE染色。
管,1 250 r/min,离心5 min。加入红细胞裂解液混匀, 1.2.9 免疫荧光检测CD206、iNOS的表达
再次离心,加入含有M⁃CSF的DMEM完全培养液,以 肝脏肿瘤标本石蜡切片脱蜡、抗原修复、血清
1×10 个/mL 密度铺在 6 孔板上,添加培养基,置于 封闭后,与一抗4 ℃孵育过夜,再加对应的HRP标记
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37 ℃、5%CO2培养箱内培养,第4天换液,第7天观察 的二抗室温孵育50 min。PBS洗涤3次后滴加TSA,
细胞形态及贴壁情况。根据已发表文献结合 String 避光室温孵育10 min,TBST洗涤3次。滴加DAPI复
数据库查找与巨噬细胞有关的乳酸化位点并定制抗 染,封片,于荧光显微镜下观察并采集图像。
体RIG⁃I lys 852 Ab、HMGB1 lys88 Ab和HMGB1 lys114 Ab。处理 1.2.10 细胞免疫荧光检测
分为6组:①对照组(Con);②乳酸组(15 mmol/L Lac); 将细胞悬液接种的 6 孔板中,培养过夜后用
③ RIG ⁃ I lys852 Ab 组(15 mmol/L Lac + RIG ⁃ I lys852 Ab PBS 冲洗 2 次,加入 4%多聚甲醛溶液固定 15 min。

