Page 40 - 南京医科大学自然版

第45卷第10期
·1408 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2025年10月

A B The number of SNPs within 1 000 Mb window size C QQ⁃plot
20 21 22 1
19 10
18 2 0 Mb 22 Mb 44 Mb 66 Mb 88 Mb 110 Mb 132 Mb 154 Mb 176 Mb 197 Mb
17 0 （P） 8
16 25 3 Chr1
50
15 75 Chr2 6
100 Chr3 Observed⁃lg 4
Chr4
14 4
Chr5 2
Chr6
13 Chr7 0
5
Chr8
12 Chr9 Density 0 1 2 3
Chr10 Expected⁃lg（P）
6
11 Chr11 0
Chr12 1
7
10
Chr13 2
8
9
Chr14 3 4
Chr15 5
Chr16 6
Chr17 7
Chr18 8
Chr19 9
Chr20 10
Chr21 11
Chr22 12
A：Manhattan plot shows the chromosomal location of SNPs and their associated P⁃values. B：SNP density plot shows the distribution of SNPs
across chromosomes. C：QQ plot shows the consistency between observed SNPs and expected distributions.
图2 ieu⁃b⁃4960数据里SNP位置及P值大小
Figure 2 SNP positions and P values in the ieu⁃b⁃4960 dataset
A 21 22 1 B The number of SNPs within 1 000 Mb window size C QQ⁃plot
19 20 10
18 2 0 Mb 24 Mb 48 Mb 72 Mb 96 Mb 120 Mb 144 Mb 168 Mb 192 Mb 216 Mb
17 0 （P） 8
16 25 3 Chr1
50 6
15 75 Chr2
Chr3 Observed⁃lg
100 4
14 4 Chr4
Chr5 2
Chr6
13 Chr7 0
Chr8
5
12 Chr9 Density 0 1 2 3
Chr10 Expected⁃lg（P）
6
11 0
Chr11
Chr12 1
7
10
2
Chr13
8
9
Chr14 3 4
Chr15 5
Chr16 6
Chr17 7
Chr18 8
Chr19 9
Chr20 10
Chr21 11
Chr22 12
A：Manhattan plot shows the chromosomal location of SNPs and their associated P⁃values. B：SNP density plot shows the distribution of SNPs
across chromosomes. C：QQ plot shows the consistency between observed SNPs and expected distribution.
图3 ebi⁃a⁃GCST90018841数据里SNP位置及P值大小
Figure 3 SNP positions and P values in the ebi⁃a⁃GCST90018841 dataset
ST90018841之间的正相关性在FDR矫正前具有统计 2.5 Meta分析
学意义，但矫正后不具有统计学意义。同时，ebi⁃a⁃ 普通 MR 中 IVW 结果具有争议的 3 组 ieu⁃b⁃
GCST90006914 与 ebi⁃a⁃GCST003739 之间在 FDR 矫 4905 结果数据进行 Meta 分析，并进行可视化处理，
正前具有统计学意义但矫正后其负相关性无统计学 结 果 存 在 明 显 异 质 性（I =82% ，τ =0.009 0，P <
2
2
意义，其中ukb⁃b⁃531与ebi⁃a⁃GCST90018841因存在 0.01），随机效应模型结果显示抗 HP IgG 水平与 EC
多重共线性无法进行贝叶斯加权MR。其余数据均 之间无显著相关性［OR=1.091 7；95%CI：0.966 2~
显示无统计学意义（图10~12）。 1.233 4，图13］。