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第45卷第12期         侯超群,葛万里,彭云鹏,等. α⁃酮戊二酸通过XRCC3诱发急性胰腺炎发病的机制研究[J].
                 2025年12月                    南京医科大学学报(自然科学版),2025,45(12):1756-1765                      ·1759 ·


                XRCC3的表达水平。                                       和转录因子等更深入地挖掘和分析。
                1.2.8  实 时 荧 光 定 量 PCR(quantitative real time     1.3  统计学方法
                polymerase chain reaction,RT⁃qPCR)                    本 MR 主要研究血清代谢物与 AP 的双向因果
                    按照 TRIzol 试剂使用说明书提取细胞总 RNA,                   关 联 。 以 逆 方 差 加 权(inverse variance weighted,
                用逆转录试剂盒(HiScript Ⅱ Q Select RT SuperMix           IVW)法为主要方法评估不同SNP的因果效应;另用
                for qPCR)将 RNA 反转录成 cDNA。采用 RT⁃qPCR               孟德尔随机化⁃Egger 回归(Mendelian randomization⁃
                法,以β⁃actin 为内参基因检测 XRCC3 的 mRNA 水                 Egger regression,MR⁃Egger)、加权中位数、简单模式

                平。XRCC3上游引物序列:5′⁃GCTACCGAGTGCCT⁃                  及加权模式法验证IVW结果。其中 MR⁃Egger 法通
                GAAGAA⁃3′;下游引物序列:5′⁃CAGCAGAATG⁃                   过加入截距项检测水平多效性。进一步使用 Co⁃
                GAGTAGCCACA⁃3′;β⁃actin 上游引物序列:5′⁃ AG⁃             chran’s Q和MR⁃PRESSO 评估SNP间异质性并识别
                ATGTGATCAGCAAGCAG⁃3′;下游引物序列:5′⁃GC⁃                潜在异常SNP。所有统计分析在 R 3.6.3 中完成,使
                GCAAGTTAGGTTTTGTCA⁃3′。                            用TwoSampleMR 0.5.6 和 MR⁃PRESSO 1.0包。后续
                1.2.9 转录组测序                                       验证实验中,结果以均值±标准差(x ± s)的形式呈
                    从每个胰腺样本的200 mg组织中提取RNA,对                      现,采用 SPSS 20.0 统计软件进行统计学分析,两组
                照组和αKG组的小鼠各取3个独立样本送至华大基                           间比较采用t检验。P < 0.05为差异有统计学意义。
                因(深圳)进行 RNA 测序。随后按照制造商的方案
                                                                  2  结 果
                制备cDNA文库。构建好的文库在合格后进行质量
                检测和测序。测序获得的数据称为原始读段或原                             2.1  AP血清代谢物特征
                始数据。经过质量控制后,将过滤后的干净读段与参                               首先基于两轮独立的 MR 研究,在遗传层面探
                考序列进行比对。比对完成后,通过统计比对率、读                           索了血清代谢物与AP 发病间的因果关系。研究结
                段在参考序列上的分布等,经过第2次质量控制(比                           果显示,αKG、INDO等代谢物可能与AP间存在因果
                对质量控制),对基因进行定量分析以及基于基因表                           关系,而后基于两轮结果的 Meta 分析进一步表明,
                达水平的各种分析(主要包括成分、相关性、差异基因                          αKG 可能是该疾病的致病因素,而 INDO 则是保护
                筛选等),并针对所选样本中差异表达的基因进行基                           因素(表1、图1)。
                因本体论(gene ontology,GO)功能显著性富集分析、                  2.2  αKG抑制AR42J细胞活性
                通路显著性富集分析、聚类、蛋白质相互作用网络                                为进一步验证αKG、INDO 在 AP 发病过程所发

                                       表1 与AP存在因果关系的血清代谢物(基于两轮独立MR分析)
                       Table 1 Serum metabolites causally associated with AP(based on two rounds of independent MR analyses)
                      Exposure       Method       NSNP        β         SE        OR         95%CI         P
                   αKG                IVW          11         1.02      0.42      2.77      1.22-6.25     0.01
                   αKG                IVW          11         1.07      0.46      2.92      1.18-7.26     0.02
                   bilirubin(E,E) *   IVW          14         0.33      0.13      1.39      1.08-1.80     0.01
                   bilirubin(E,E) #   IVW          08         0.37      0.18      1.45      1.02-2.06     0.04
                   bilirubin(Z,Z) *   IVW          19         0.22      0.09      1.25      1.04-1.49     0.02
                   bilirubin(Z,Z) #   IVW          09         0.34      0.13      1.40      1.08-1.83     0.01
                          *
                   biliverdin         IVW          27         0.26      0.13      1.29      1.01-1.66     0.04
                   biliverdin #       IVW          13         0.40      0.20      1.49      1.01-2.21     0.05
                   INDO               IVW          16        -0.56      0.19      0.57      0.39-0.83     0.00
                   INDO               IVW          14        -0.73      0.26      0.48      0.29-0.81     0.01
                   X⁃11530 *          IVW          19         0.43      0.15      1.53      1.15-2.04     0.00
                   X⁃11530 #          IVW          10         0.56      0.21      1.75      1.16-2.65     0.01
                         *
                   X⁃12329            IVW          25         0.06      0.03      1.06      1.00-1.12     0.03
                   X⁃12329 #          IVW          24         0.09      0.04      1.09      1.01-1.18     0.03
                   *denotes the ebi⁃a⁃GCST90018789 dataset;#denotes the finn⁃b⁃K11_ACUTPANC dataset. IVW:inverse variance weighted;NSNP:number of
                SNPs;Beta:Beta coefficient;SE:standard error;OR:odds ratio;95% CI:95% confidence interval.
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