Page 58 - 南京医科大学自然版
P. 58

第45卷第4期
               ·494 ·                            南 京    医 科 大 学 学         报                        2025年4月


              经活性和突触相关通路(图4B)。通过String数据库                       RNA 剪接和代谢功能(调节 RNA 剪接/mRNA 处
              构建PPI网络,最终得到包含 511 个节点、197 条边                     理/mRNA 代谢过程)以及肌肉运动功能(肌肉肌球蛋
              的 PPI 网络。根据基因在整个网络中的重要性对                          白复合体/肌球蛋白丝/肌动蛋白细胞骨架),其中具有
              子网络进行打分排序,并选择得分最高的子网络                             两个以上连接点的包括Cdh5、Adgrf5、Adcy4、Robo4、
              [18] 。主要分为 3 个集团,分别是血管发生功能(血                      Ccna2、Pbk、Kif22、Pnisr、Rbm25、Snmp70、Trn等39个
              管发育/内皮细胞分化/跨膜受体蛋白激酶活性)、                           核心基因(图 4C、D)。

                 A                                           B
                     12M HD vs. WT UP  12M HD vs. WT DOWN             PI3K⁃Akt signaling pathway      Count
                             1 532       176                          Calcium signaling pathway
                                                               Neuroactive ligand⁃receptor interaction  4
                                                                         Ras signaling pathway          8
                            76              2                          MAPK signaling pathway           12
                                                               Cytokine⁃cytokine receptor interaction   16
                        799                   783                       Rap1 signaling pathway
                                                                         Glutamatergic synapse
                    WT 12M vs. 3M UP                                                                  P value
                                        WT 12M vs. 3M DOWN             Relaxin signaling pathway
                                                                            ABC transporters            0.04
                             59          687                             Circadian entrainment          0.03
                                                                   Protein digestion and absorption
                                                                        HIF⁃1 signaling pathway         0.02
                                                                           GABAergic synapse            0.01
                                                                     Hedgehog signaling pathway
                                                                                       0.02 0.04 0.06 0.08
                                                                                           Gene ratio
                          C               Clic5                                Pbk   Rad54l
                                   Sox17        Thsd1
                                                                                                 Kifc2
                                                                                            Zcwpw2
                                      Ushbp1  Tie1
                                                  Tek                                   Prc1
                                                                             Neil3  Ccna2
                                Acer2
                                                                         Fbxo5
                                            Ccm2l            Guf1  Fit3l                  Bora
                                                    Fgd5
                              Clec14a  Cdh5                         Zfp593            Rad54b  Kit22
                                                     Slit1  Eif2s3x           Cdk2  Orc1
                                 Kdr      Adgrf5
                                                Robo4                  Gcfc2
                                                                Npsr1
                                                           Gnb3
                                                     Vwf                              Mtfr2
                              Vegfd      Adcy4                      Cep152  Dqx1  Txnl4a
                                                 Afap1l1
                                  Cd93      Egfl7                                 Prpf39
                                                           Kcnrg  Ddx17  Spaca6       Clk4
                                       Acvrl1  Kank3                       Rnpc3            Clk1  Ccnl1
                                                                   Tia1
                                                                              Rbm25  Srsf5
                                                                                        Rsrp1
                                                                       Snrnp70               Ccnl2
                                                                                     Ogt
                                     Gapdhs      Pln                      Ttc14           Tet2
                                                                  Safb2        Pnisr
                                                                                   Son
                                                                     Pabpn1
                                                                          Pnn
                                       Eno3                                            Arglu1
                                                  Myh6
                                                                                          Sfswap
                                                                    Zcchc7      Rbm5
                                                                                    Fnbp4
                                                                          Nktr
                                            Ttn
                                                                                       Paxbp1
                                                                       Zc3h7a
                                   Ankrd23                                 Ptges3l  Cmtr1
                                             Myh2
                                 Vessel development/endothelial cell differentiation/transmembrane receptor protein kinase activity
                                 Muscle myosin complex/myosin filament/actin cytoskeleton
                                 Regulation of RNA splicing/mRNA processing/mRNA metabolic process
                     D
                                                                                                 Group
                                                                                                  HD
                                                                                                  WT
                                                                                                 Expression
                                                                                                  2
                                                                                                  1
                                                                                                  0
                                                                                                  -1
                                                                                                  -2
                             Npsr1  Flt3l  Afap1l1  Ccm2l  Adcy4  Rad54b  Tek  Kdr  Cdh5  Adgrf5  Tie1  Cd93  Egfl7  Cep152  Ttn  Rad54l  Prpf39  Fnbp4  Srsf5  Snrnp70  Eno3  Ttc14  Nktr  Pnisr  Spaca6  Rbm25  Ogt  Rbm5  Son  Rsrp1  Ankrd23  Rnpc3  Ccna2  Kif22  Orc1  Neil3  Bora  Prc1  Pbk
                 A:The Venn diagram of DEGs in the progression of HD and aging process. B:KEGG enrichment analysis of DEGs specifically altered in the pro⁃
              gression of HD. C:Module of PPI network constructed by STRING(database:https://string⁃db.org/,PPI enrichment P < 0.001). D:Expression heatmap
              of predicted key dots.
                                                  图4  HD病程关键基因PPI网络
                                         Figure 4  PPI network of core genes in the course of HD
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