Page 78 - 南京医科大学自然版

第45卷第4期
·514 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2025年4月

和肿瘤坏死因子（tumor necrosis factor，TNF）的表达 免疫细胞差异分析图证实了这些发现，在不同亚组
水平较高。相反，在各基因簇之间，BCL2⁃拮抗剂/杀 之间，幼稚B细胞、调节性T细胞、单核细胞、巨噬细
伤 因 子 1（BCL2 ⁃ antagonist/killer 1，BAK1）、BAX、 胞 M0、活化的肥大细胞和中性粒细胞差异有统计学
CASP1、环叶素依赖性激酶底物（cyclophlin⁃depen⁃ 意义（P < 0.05，图5B）。此外，为了证实PRG与PCOS
dent kinase substrate，CYCS）和其他基因的表达未观 之间的相关性，对这两个亚型与细胞因子之间的相
察到显著差异（图 4D、E）。GSVA 分析图突出显示 关性进行了深入探索。分析显示，细胞因子表达在
了亚型之间的差异通路（图 4F）。在 C2 亚组中，丙 基因簇之间存在显著差异（图5C）。值得注意的是，
酸盐代谢、细胞周期、泛酸盐和辅酶 a 生物合成、半 白细胞介素 1 受体拮抗因子（interleukin 1 receptor
胱氨酸和蛋氨酸代谢以及p53信号通路表现出正调 antagonist，IL1RN）、IL6、IL10、IL16、IL32、转化生长
控关系，而在 C1 亚组中，核糖体、细胞质 DNA 感应 因子B1（transforming growth factor beta 1，TGFB1）、细
通路和造血细胞谱系表现出正调控关系。 胞因子信号通路抑制因子 3（suppressor of cytokine

2.5 基于细胞PRG亚型的免疫状况 signaling 3，SOCS3）、CXC 基 序 趋 化 因 子 10（CXC
直方图分析显示不同组免疫细胞浸润模式不 chemokine ligand 10，CXCL10）和 TNF 在 cluster 2 中
同。Cluster 1组的幼稚B细胞、记忆B细胞和中性粒 的表达水平高于cluster 1。这些发现进一步证实了
细胞水平较高，而 Cluster 2 组的静息单核细胞和肥 程序性细胞死亡cluster 2与PCOS的密切相关性。
大细胞水平较高。其他免疫细胞含量组间差异相 2.6 特征基因的功能富集分析
对较小（图 5A），但具体原因尚需进一步实验验证。 对模型基因通过基因集富集分析法（gene set

A
0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100
Points
NLRP2
5.0 5.5 6.0 6.5 7.0 7.5 8.0 8.5 9.0
CHMP4B
7.4 8.6
AIM2
4.0 4.5 5.0 5.5 6.0 6.5 7.0 7.5
NLRC4
3.5 4.0 4.5 5.0 5.5 6.0 6.5 7.0
PYCARD
6.0 6.5 7.0 7.5 8.0 8.5 9.0 9.5 10.0
Total points
0 20 40 60 80 100 120 140 160 180 200 220
Risk of disease
0.10 0.30 0.50 0.70 0.90 0.99
0.00
B 1.0 C PRG
All
None
0.6
0.8
Actual probability 0.6 Net benefit 0.4

0.4
0.2
0.2 Apparent
Bias⁃corrected 0
Ideal
0
0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0
0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0 Threshold probability
Predicted probability
1∶100 1∶4 2∶3 3∶2 4∶1 100∶1
Cost：Benefit ratio
A：Nomogram showing prediction of PCOS prevalence using signature genes. B：Calibration curve illustrating the accuracy of nomogram. C：Deci⁃
sion curve illustrating the accuracy of the model.
图3 预测列线图的评估
Figure 3 Evaluation of a predictive nomogram