Page 83 - 南京医科大学自然版
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第45卷第4期 陈 讯,陈雯昕,张 文,等. 基于焦亡相关基因构建多囊卵巢综合征诊断模型[J].
2025年4月 南京医科大学学报(自然科学版),2025,45(4):509-522 ·519 ·
A B
AIM2 High Low CHMP4B High Low
** * * ** **
10.0 10.0
Fraction 7.5 Fraction 7.5
5.0 5.0
2.5 2.5
IL1A IL1RN IL1R1 IL2RA IL4 IL6 IL6ST IL10 IL15 IL16 IL18 IL32 TNF IFNG TGFB1 LIF SOCS3 SOCS4 SOCS5 SOCS6 SOCS7 CISH CRLF3 CCL5 STAT3 STAT1 TLR4 JAK2 CXCL10 IK CIAPIN1 IL1A IL1RN IL1R1 IL2RA IL4 IL6 IL6ST IL10 IL15 IL16 IL18 IL32 TNF IFNG TGFB1 LIF SOCS3 SOCS4 SOCS5 SOCS6 SOCS7 CISH CRLF3 CCL5 STAT3 STAT1 TLR4 JAK2 CXCL10 IK CIAPIN1
C NLRC4 High Low D NLRP2 High Low
* * * *
10.0 10.0
Fraction 7.5 Fraction 7.5
5.0 5.0
2.5 2.5
IL1A IL1RN IL1R1 IL2RA IL4 IL6 IL6ST IL10 IL15 IL16 IL18 IL32 TNF IFNG TGFB1 LIF SOCS3 SOCS4 SOCS5 SOCS6 SOCS7 CISH CRLF3 CCL5 STAT3 STAT1 TLR4 JAK2 CXCL10 IK CIAPIN1 IL1A IL1RN IL1R1 IL2RA IL4 IL6 IL6ST IL10 IL15 IL16 IL18 IL32 TNF IFNG TGFB1 LIF SOCS3 SOCS4 SOCS5 SOCS6 SOCS7 CISH CRLF3 CCL5 STAT3 STAT1 TLR4 JAK2 CXCL10 IK CIAPIN1
E
PYCARD High Low
* *
10.0
Fraction 7.5
5.0
2.5
IL1A IL1RN IL1R1 IL2RA IL4 IL6 IL6ST IL10 IL15 IL16 IL18 IL32 TNF IFNG TGFB1 LIF SOCS3 SOCS4 SOCS5 SOCS6 SOCS7 CISH CRLF3 CCL5 STAT3 STAT1 TLR4 JAK2 CXCL10 IK CIAPIN1
A:Differential expression analysis of cytokines for AIM2. B:Differential expression analysis of cytokines for CHMP4B. C:Differential expression
analysis of cytokines for NLRC4. D:Differential expression analysis of cytokines for NLRP2. E:Differential expression analysis of cytokines for
*
**
PYCARD,P < 0.05 and P < 0.01.
图8 特征基因的细胞因子差异表达分析
Figure 8 Differential expression analysis of cytokines for signature genes
制尚不明确。因此,本研究试图通过生物信息学分 本 研 究 最 初 选 择 的 5 个 基 因 是 CHMP4B、
析来阐明PRG在PCOS和免疫微环境中的作用。此 PYCARD、NLRP2、NLRC4和AIM2。随后,通过共识
外,使用与细胞焦亡相关的遗传标记来预测 PCOS 聚类,确定了PCOS的两个不同亚型,称为Cluster 1和
亚型。首先,对 PRG 在 PCOS 患者和正常对照中的 Cluster 2。进一步分析了两个亚型之间的差异表达
表达和通路进行了分析。在 PCOS 患者中,观察到 的 PRG,以识别具有显著表达差异的基因簇。与
PYCARD、AIM2和NOD2基因表达水平显著上调,表 Cluster 1 相比,Cluster 2 中 PRG 的表达水平显著升
明这些PRG 可能参与PCOS 的发生发展 [20-22] 。这提 高,强调了这一区别的关键作用。研究表明,PCOS
示细胞焦亡可能在 PCOS 的发病机制中起重要作 的特征是激素异常,过度刺激免疫系统,导致慢
用。随后,利用这些PRG建立了4个预测模型,以进 性低水平炎症,进而导致卵巢功能障碍和代谢紊
一步研究细胞焦亡和PCOS之间的相互作用。在这 乱 [24-25] 。鉴于慢性低水平炎症在 PCOS 中的突出作
些模型中,选择 XGB 作为最好的机器学习模型。 用,本研究比较了不同组间的免疫细胞浸润和细胞
XGB 是一个并行预测模型,它使用多棵树,并不断 因子水平。值得注意的是,Cluster 2 表现出较高水
迭代,在每次迭代时生成更新的树 [23] ,使预测值与 平的免疫细胞浸润,这与之前的研究一致,并且在
真实值密切一致,成为本研究的有效模型。 各基因组亚型中均观察到这些浸润趋势。此外,

