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第41卷第10期 陈红全,王建瑛. 利用可诱导表达Cas9的HeLa细胞系进行顺铂耐药性基因筛选[J].
2021年10月 南京医科大学学报(自然科学版),2021,41(10):1432-1439,1452 ·1435 ·
(续表1)
名称 序列(5′-3′)
58GCNF atgCGTCTCaACCGATCCAGGCTGCGAGCTTGTgttttagagctagaaatagcaag
59NR0B1 atgCGTCTCaACCGCAGCGGTACAGGAGTGCCAgttttagagctagaaatagcaag
60NR0B1 atgCGTCTCaACCGGCCGTGCCTCGGGCGCTGCgttttagagctagaaatagcaag
61NR0B2 atgCGTCTCaACCGCAGCTGCCAGAAGGATGGCgttttagagctagaaatagcaag
62NR0B2 atgCGTCTCaACCGCACCGCAGCCAGGGAGGGCgttttagagctagaaatagcaag
63NR2E1 atgCGTCTCaACCGGCCACTTGCTTGCGGATGGgttttagagctagaaatagcaag
64NR2E1 atgCGTCTCaACCGCGGTGAAGAAGGCCGGCGCgttttagagctagaaatagcaag
65NR2E3 atgCGTCTCaACCGAGCCACCAGGGACTCCGGCgttttagagctagaaatagcaag
66NR2E3 atgCGTCTCaACCGGTTTCAGCTGTTATAAGGCgttttagagctagaaatagcaag
67NR1D1 atgCGTCTCaACCGGAGCCGTCATCACTCAGGCgttttagagctagaaatagcaag
68NR1D1 atgCGTCTCaACCGCTCCCATTATAGAAGGAGGgttttagagctagaaatagcaag
69NR1D2 atgCGTCTCaACCGGTCGCAGCTGTTCCTGGGCgttttagagctagaaatagcaag
70NR1D2 atgCGTCTCaACCGGGAATCCGTTCTCCTCTCTgttttagagctagaaatagcaag
71NR2F1 atgCGTCTCaACCGGCCCGAACCGGGCGGGCCCgttttagagctagaaatagcaag
72NR2F1 atgCGTCTCaACCGTCGATGGGACAGTTCCTGTgttttagagctagaaatagcaag
73NR2F2 atgCGTCTCaACCGCAGGGAAATATATCCGGACgttttagagctagaaatagcaag
74NR2F2 atgCGTCTCaACCGCCGAAGCGCGACGTGGGATgttttagagctagaaatagcaag
75NR2F6 atgCGTCTCaACCGAGGAGGCGGCCACGGCACCgttttagagctagaaatagcaag
76NR2F6 atgCGTCTCaACCGCGTCCGGCCGCCGCAGGGTgttttagagctagaaatagcaag
77RORA atgCGTCTCaACCGTCAGCGGCTCAGCCTCTCCgttttagagctagaaatagcaag
78RORA atgCGTCTCaACCGTGAAGTTCCGTCAGCCCGTgttttagagctagaaatagcaag
79RORB atgCGTCTCaACCGCTTCTGCACCTCAGCATACgttttagagctagaaatagcaag
80RORB atgCGTCTCaACCGTTGTAATAACCCTCAGACTgttttagagctagaaatagcaag
81RORg atgCGTCTCaACCGGCTCCGGCGGAAGAAGCCCgttttagagctagaaatagcaag
82RORg atgCGTCTCaACCGCGCCAGGCATTTCTGCAGGgttttagagctagaaatagcaag
83PXR atgCGTCTCaACCGCATGGTTCCAGCTTTCTTTgttttagagctagaaatagcaag
84PXR atgCGTCTCaACCGACATTGAAGTGATAGCCAGgttttagagctagaaatagcaag
85CAR atgCGTCTCaACCGCTTTGCTCGCCGCAATGCCgttttagagctagaaatagcaag
86CAR atgCGTCTCaACCGGTGCCCATGTGGCGGGTGTgttttagagctagaaatagcaag
87ERb atgCGTCTCaACCGGGCTTGTGGTCTGCCGACCgttttagagctagaaatagcaag
88ERb atgCGTCTCaACCGATGGACCACTAAAGGAGAAgttttagagctagaaatagcaag
89ERRa atgCGTCTCaACCGTGGCCTGGGAGGCAGCGAGgttttagagctagaaatagcaag
90ERRa atgCGTCTCaACCGAAGGCTTTGCAGGCCTCACgttttagagctagaaatagcaag
91ERRb atgCGTCTCaACCGAGCATGTACTCGCACTTGAgttttagagctagaaatagcaag
92ERRb atgCGTCTCaACCGCACACGAGGCACAGGCGCTgttttagagctagaaatagcaag
93ERRg atgCGTCTCaACCGGCATGGCATAGATCTTCTCgttttagagctagaaatagcaag
94ERRg atgCGTCTCaACCGATAACCACCAACTCTCGGTgttttagagctagaaatagcaag
HeLa8E 克隆细胞经扩增后加入 Dox,以诱导 Research 公司,美国)二抗和Hoechst 33258(Sigma公
Cas9 的表达和对目标基因的编辑。分别加入 0.3、 司,美国)加入PBS,并室温孵育细胞1 h,PBS 洗 3 次
0.9、1.5 μg/mL 顺铂处理细胞48 h,在对照细胞(未加 后用 Vectashield Mounting medium(Vector Laborato⁃
Dox)全部死亡之后,撤掉顺铂。由于0.3 μg/mL的顺 ries 公司,日本)进行封片。所有免疫荧光图片用
铂不能使对照细胞全部死亡,后续实验从0.9 μg/mL Olympus Flueview 1000 激光共聚焦显微镜拍摄。
和1.5 μg/mL两组中挑选单克隆进行。 1.2.4 T7EN1切割检测
1.2.3 免疫荧光染色 收集的细胞用裂解液(10 μmol/L Tris⁃HCl,
HEK293T 细胞培养在包被了多聚赖氨酸的盖 0.4 mol/L NaCl,2 μmol/L EDTA,1% SDS,100 μg/mL
玻片上,转染72 h之后,细胞直接用于拍照,或者用 Proteinase K)在 58 ℃水浴锅中消化过夜,用酚氯仿
4%的 PFA(paraformaldehyde)室温固定 15 min,PBS 抽提裂解物,然后用乙醇沉淀得到DNA。目的DNA
洗 2 次,用含 0.2% Triton 100 的 PBS 处理 5 min 以增 片段通过PCR 从基因组中扩增出,PCR 产物用PCR
加细胞膜的渗透性,然后用标准羊血清(武汉博士 cleanup kit(Axygen 公司,美国)纯化,吸取 200 ng 纯
德公司)室温封闭 30 min。用加抗⁃Flag M2(Sigma 化后的 PCR 产物,在 20 μL 的 1×NEBuffer 2(NEB 公
公司,美国)的封闭液室温孵育 2 h。PBS 洗 2 次后, 司,美国)体系中退火,退火程序为95 ℃ 5 min;95 ℃~
将cy3⁃conjugated⁃goat⁃抗⁃mouse IgG(Jackson Immuno⁃ 85 ℃,每秒降低1 ℃;85 ℃~25 ℃,每秒降0.1 ℃;4 ℃