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第41卷第10期            陈红全,王建瑛. 利用可诱导表达Cas9的HeLa细胞系进行顺铂耐药性基因筛选[J].
                 2021年10月                  南京医科大学学报(自然科学版),2021,41(10):1432-1439,1452                   ·1437 ·


                A                              B   15                  D          hrGFP              Merge
                            NLS⁃Flag⁃Cas9⁃NLS
                        NLS⁃Flag⁃Cas9  NLS⁃Flag⁃Cas9⁃NP  ( % )  10
                                     Cas9⁃NLS
                (bp)                      Cas9⁃SP Ctrl
                2 000-                             切割效率  5
                1 000-                                                     -Dox
                 750-
                 500-
                                                    0
                 250-
                                                  NLS⁃Flag⁃Cas9
                                                      NLS⁃Flag⁃Cas9⁃NP
                                                  NLS⁃Flag⁃Cas9⁃NLS
                 100-                                        Cas9⁃NLS Cas9⁃SP
                C
                             NLS⁃Flag⁃ IRES⁃
                   3LTR  TRE               pA    pA    BleoR  Sv40 Pro  5LTR  +Dox
                             Cas9⁃NLS hrGFP
                                     IRES⁃
                   3LTR  TRE  Cas9⁃NLS     pA    pA    BleoR  Sv40 Pro  5LTR
                                     hrGFP
                         E
                                   Flag              hrGFP             Hoechst            Merge










                   A:不同版本Cas9在RAG1基因上的切割效率;B:对A图的光密度定量分析,数据以平均值±标准差呈现(n=3),组间差异无统计学意义;
                C:载体构建示意图;D:HEK293T细胞中,转座子载体在Dox诱导下的GFP表达情况(×200),标尺:100 μm;E:PFA固定过的HEK293T细胞中,
                Cas9和GFP的表达情况(×1 800),标尺:10 μm。
                                                图1 可诱导表达Cas9载体的构建和验证
                                   Figure 1 Construction and verification of inducible Cas9 expression vector

                             A  (bp)                         B
                               2 000-                          GCTTTGGTGTCTGCTTTGATGGACATGGAAGAA (ref)
                               1 000-  1A 1G 2B 3G 5H 8E 10A   GCTTTGGTGTCTGCTTTGATGGACATGGAAGAA (WT,x2)
                                750-                           GCTTTGGTGTCTGCTTTGATG∶ACATGGAAGAA (-1,x6)
                                500-                           GCTTTGGTGTCTGCTTTGAT∶∶ACATGGAAGAA (-2)
                                                               GCTTTGGTGTCTGCTTTGA∶∶∶ACATGGAAGAA (-3)
                                250-                           GCTTTGGTGTCTGCTTTGA∶∶∶∶CATGGAAGAA (-4)
                                                               GCTTTGGTGTCTGCTTT∶∶t∶∶ACATGGAAGAA (-5,+1)
                                100-                           GCTTTGGTGTCTGCTTTGATG∶∶∶∶∶∶GAAGAA (-6)
                                                               GCTTTGGTGTCTGCTTTG∶∶∶∶∶∶ATGGAAGAA (-6)
                                                               GCTTTGG∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶GACATGGAAGAA (-14)
                                                               G∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶∶GAA (-29)
                                                               GCTTTGGTGTCTGCTTTGATG∶∶CATGGAAGAA (-2,+11)
                                                                               tttgcttcttc
                   C                                               D
                                                   Esp3l             (bp)      ERb    ERRa     ERRb    ERRg
                                                                    2 000-
                             ACCGgGAGACG          CGTCTCcTAAATTCT
                        U6                  ccdB                            R1 R2 Ctrl R1 R2 Ctrl R1 R2 Ctrl R1 R2 Ctrl
                             TGGCcCTCTGC          GCAGAGgATTTAAGA   1 000-
                                                                      750-
                                   Esp3l
                                                                      500-
                        Esp3l
                                                                      250-
                     atgCGTCTCaTAAA                   TAAAcGAGACGgtg
                                   19N   sgRNA backbone
                     tacGCAGAGtATTT                   ATTTgCTCTGCcac
                                                                      100-
                                                            Esp3l
                   A:7株单克隆细胞在RAG1基因上的切割效率;B:8E克隆中,RAG1⁃sgRNA切割效果的TA克隆测序结果。PAM(protospacer adjacent mo⁃
                tif)序列用绿色加下划线表示;sgRNA作用靶点用红色表示;突变处用蓝色加小写字母表示;-代表碱基缺失,+代表碱基插入;×n代表TA克隆
                数;C:高通量构建sgRNA载体示意图,箭型代表Esp3Ⅰ内切酶的识别位点,蓝色虚线代表内切酶切割位点,19N代表sgRNA识别位点;D:针对
                每个基因设计2条sgRNA,共同电转8E细胞株,PCR扩增之后可以检测到片段缺失,R1和R2代表重复2次。
                                            图2   可诱导表达Cas9的稳定细胞系的构建和验证
                          Figure 2  Generation and verification of a stable HeLa cell line with inducible expression of Cas9
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