Page 16 - 南京医科大学学报自然科学版
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第43卷第1期
· 10 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2023年1月
和 psPAX2 共转染 HEK293T 细胞进行慢病毒的包 1.2.6 CUT&RUN⁃qPCR实验
装,转染 60 h 后收集细胞上清并用 0.45 μm 的滤 CUT&RUN 试剂盒为美国 CST 公司产品,按照
器 过 滤 ;使 用 慢 病 毒 液 分 别 感 染 SMMC7721 和 试 剂 盒 操 作 说 明 书 操 作 。 简 要 过 程 如 下 :
SK⁃HEP1肝癌细胞后,采用嘌呤霉素筛选14 d获得 SMMC7721 细胞与磁珠孵育后,加入兔抗人 YAP
稳定细胞株。 单克隆抗体与细胞中 YAP 结合,与二抗孵育后加
1.2.3 实时定量PCR(real⁃time quantitative PCR,RT⁃ 入 Protein A/G⁃Tn5 转座体与抗体结合后,再加入
qPCR)检测相关基因的mRNA表达水平 Mg 激活转座体,使得 DNA 片段化,提取 DNA 进行
2+
TRIzol 试剂盒提取对数生长期的各组细胞的 qPCR 验证,qPCR 上游引物序列为 5′⁃CATGGTGC⁃
总 RNA 后,采用 HiScript Q RT SuperMix for qPCR GCCCAGGAG ⁃ 3′ ,下 游 引 物 序 列 为 5′ ⁃ GGCCT⁃
试剂盒和 AceQ qPCR SYBR Green Master Mix 试剂 CAGGGTGGAAATCTG⁃3′。分别计算 YAP 抗体和
盒分别进行逆转录和qPCR。qPCR反应条件:95 ℃ IgG 富集后扩增的 DNA 占输入染色质的比值,实验
5 min 预变性;95 ℃ 10 s,60 ℃ 34 s,40 个循环。 结果用 YAP 抗体富集的 DNA 与 IgG 富集的 DNA 的
EEF1A2 的上游引物序列为 5′⁃GGACCATTGAGAA 倍数表示。
GTTCGAGA⁃3′,下游引物序列为 5′⁃AGCACCCAG⁃ 1.3 统计学方法
GCATACTTGAA⁃ 3′;Snail 的上游引物序列为 5′⁃ 应用软件SPSS19.0和Excel 2013对数据进行分
AATCGGAAGCCTAACTACAGCG⁃3′,下游引物序列 析,数据采用均值±标准差(x ± s)表示,两组间比较
为 5′⁃GT CCCAGATGAGCATTGGCA⁃3′;E⁃cadherin 采用t检验,P < 0.05为差异有统计学意义。
的上游引物序列为5′⁃CAAGTGACC ACCTTAGAG⁃3′,
下游引物序列为 5′⁃GAATTTGCAATCCTGCTT⁃3′; 2 结 果
GAPDH 上游引物序列为 5′⁃GCACCGTCAAGGCT⁃ 2.1 YAP和EEF1A2对不同迁移能力的肝癌细胞迁
GAGAAC⁃3′,下游引物序列为5′⁃TGGTGAAGACGC⁃ 移和侵袭的影响
CAGTGGA⁃3′。使用 LightCycler 96 软件进行数据 通过查阅癌症基因组图谱(the cancer genome
®
分析,以GAPDH为内参,按照2 -ΔΔCt 方法计算出目的 atlas,TCGA)数据库(http://gepia.cancerpku.cn/index.
基因的相对表达量。 html)分析 EEF1A2 在肝癌组织以及癌旁组织中的
1.2.4 Western blot检测相关基因的蛋白表达水平 表达,结果显示 EEF1A2 在肝癌组织中的 mRNA 水
采用 RIPA 裂解液提取各组细胞中的总蛋白, 平显著高于癌旁组织(P < 0.01,图 1A)。Western
BCA 蛋白定量试剂盒进行蛋白定量、变性后进行 blot 法检测不同迁移能力的肝癌细胞系(低迁移能
SDS⁃PAGE,样品转膜至PVDF膜上,采用5%的脱脂 力的 HepG2、SMMC7721 和 Hep3B 细胞系以及高迁
奶粉封闭后与相应的一抗于 4 ℃孵育过夜;加入相 移能力的HCCLM3和SK⁃HEP1细胞系)中YAP/TAZ
应二抗室温孵育后,滴加 ECL 发光液,于全自动化 和 EEF1A2 的表达,结果显示 YAP/TAZ 和 EEF1A2
学发光仪成像。 在高迁移能力的肝癌细胞 HCCLM3 和 SK⁃HEP1 中
1.2.5 细胞迁移与侵袭实验 的 表 达 均 高 于 低 迁 移 能 力 的 肝 癌 细 胞 HepG2、
实验按文献 [10] 的方法进行,简要过程如下:选 SMMC7721 和 Hep3B(图 1B),该 结 果 表 明 YAP/
择血清饥饿过夜后的各组细胞,制备细胞悬液; TAZ 和 EEF1A2 的表达可能与肝癌细胞的迁移能
细胞计数后,用不含胎牛血清的 DMEM 培养基将 力相关。
5 为了研究YAP和EEF1A2对肝癌细胞迁移和侵
SMMC⁃7721 细胞调整为 1.5×10 个/mL,SK⁃HEP1
细胞调整为 1.0×10 个/mL;分别取 200 μL 的上述 袭 的 影 响 ,本 研 究 制 备 干 扰 YAP 表 达 和 干 扰
5
细胞悬液接种到预先铺有 Matrigel 或未铺 Matrigel EEF1A2 表达的重组慢病毒以及对照慢病毒,分别
的 Transwell 小室中,然后将 Transwell 小室放入含 感染低迁移能力的 SMMC⁃7721 细胞和高迁移能力
600 μL完全培养基的Transwell下室中,于37 ℃继续 的SK⁃HEP1细胞,采用嘌呤霉素筛选2周后,建立了
培养 24 h。取出 Transwell 小室置于 4%多聚甲醛固 稳定干扰表达细胞模型;其次,通过在SMMC7721和
定液中室温固定后,用棉签拭去小室内侧的细胞, SK⁃HEP1 细胞中分别感染表达 YAP、EEF1A2 的腺
采用结晶紫染液染色迁移和侵袭的细胞,于倒置相 病毒,构建了 YAP 和 EEF1A2 过表达的肝癌细胞模
差显微镜下观察并统计迁移和侵袭的细胞数。 型;采用 Western blot 方法进行基因表达鉴定,结果