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第43卷第10期
               ·1436 ·                           南 京    医 科 大 学 学         报                        2023年10月


              突变,能够降低全基因组中远端增强子 cBAF 结合                         因子α信号。从机制上说,一方面由于突变型p53能
              率和 DNA 可及性,产生脑膜瘤特征性的转录图                           够与 MLL4 直接相互作用,促进基因组中 p65 结合
              谱,促进肿瘤进展        [55] 。另外,SWI/SNF家族成员催化            区域H3K4me1修饰       [62] 。另一方面,突变型p53可与
              亚基染色质肌动蛋白依赖性调节因子 4(SWI/SNF                        含溴结构域 4(bromodomain containing 4,BRD4)蛋
              related matrix associated actin dependent regulator of  白直接相互作用,富集 p65 结合区域 H3K27ac 信
              chromatin subfamily A member 4,SMARCA4)的异常        号 [63] 。此外,突变型 p53 可募集 RNAPⅡ到新的增
              高表达促进 PAX3⁃FOXO1 融合阳性横纹肌肉瘤恶                       强子区域转录 eRNA,激活癌基因的转录促进结直
              性进展。SMARCA4 通过促进转录因子 MYCN 与增                      肠癌细胞的侵袭 。
                                                                               [64]
              强子的结合,升高 MYCN 反应性增强子的 H3K27ac                     5.2  转录因子异常表达与增强子活性
                                              [56]
              水平,驱动靶基因转录发挥促癌作用 。                                     肿瘤细胞中转录因子的异常高表达可改变增
                  CHD 家族成员的基因缺失或异常高表达也会                         强子组蛋白修饰调控增强子活性或者造成增强子
              改变增强子的活性,发挥促癌作用。其中,CHD1基                          重塑。例如,先驱转录因子叉头框蛋白 1(forkhead

              因在约15%的前列腺癌患者中缺失。野生型CHD1                          box A1,FOXA1)在ER阳性乳腺癌中异常高表达,通
              与 AR 在前列腺细胞特异性增强子上共定位。在                           过与 MLL3 相互作用,使基因组中 ER 结合区域
              CHD1 基因丢失后,全基因组中 AR 结合分布改变,                       H3K4me1 修饰增加,形成新的增强子致使转录激

              使其更倾向于结合在同源盒蛋白 B13(homeobox                       活,促进乳腺癌细胞增殖           [65] 。HOXA9异常高表达招
              B13,HOXB13)反应性增强子,驱动致癌途径激活相                       募CEBPα和MLL3/MLL4复合物,通过形成新的增强
              关基因的表达      [57] 。CHD8在前列腺癌细胞中异常高                 子促进白血病形成         [66] 。p63的N 末端亚型ΔNp63可
              表达,通过与AR直接相互作用,在跨膜丝氨酸蛋白                           通过招募p300重塑肺干细胞的增强子,驱动肺腺癌
                                                                           [7]
              酶2(transmembrane serine protease 2,TMPRSS2)基因     和鳞癌发生 。此外,转录因子异常高表达还能够
                                             [58]
              的增强子区域共定位,发挥促癌效应 。在横纹肌肉                           显著增加增强子与癌基因启动子的相互作用频率,
                                                                             [16]
              瘤细胞中异常高表达的CHD4蛋白与PAX3⁃FOXO1                       促进肿瘤进展 。
                                                     [59]
              蛋白协同作用,激活增强子上调癌基因表达 。                             5.3  染色体易位与增强子活性
                                                                     染色体易位形成融合基因后所编码的嵌合转
              5 转录因子异常改变增强子活性
                                                                录因子,可通过获得异常的转录活性调节增强子的
                  转录因子在调节增强子活性中发挥重要作                            活性。例如,正常肌生成早期的转录因子配对盒基
              用。转录因子的突变、表达水平异常以及染色体易                            因(paired box,PAX)家族成员和晚期调节因子肌源
              位形成融合基因后编码的嵌合转录因子能够通过                             性因子4(myogenin,MYOG)在肌肉发育过程中的表
              不同机制,使增强子活性发生异常,甚至形成增强                            达相互排斥。但是,基于染色体易位形成的融合基
              子重塑现象 。                                           因 PAX3⁃FOXO1,除了转录活性比野生型 PAX3 高
                        [60]
              5.1  转录因子突变与增强子活性                                 10~100倍之外,还与MYOG等肌源性转录因子在横
                  转录因子突变可影响其与增强子序列及共转                           纹肌肉瘤中同时高表达。二者通过招募BRD4蛋白
              录因子结合的能力,进而改变增强子活性以及基因                            增强 H3K27ac 信号,形成活性增强子,使肌源性转
                                                                                   [67]
              组增强子重塑。例如,急性髓性白血病中 CCAAT                          录失调促进肿瘤发生 。
              增强子结合蛋白α(CCAAT enhancer binding protein
                                                                6 研究增强子的方法和常用数据库
              alpha,CEBPα)的突变使其与DNA结合能力受损,导
              致 UL16 结 合 蛋 白 2(UL16 binding protein 2,               基因组中增强子的鉴定和功能研究对探讨其
              ULBP2),ULBP5 和 ULBP6 基因的增强子活性下降,                  在肿瘤中的作用具有重要意义。根据增强子的研
              使肿瘤细胞逃避自然杀伤细胞介导的细胞裂解                       [61] 。  究角度将这些研究手段分为两大类:①增强子及
              转录因子 p53 DNA 结合域的突变使之在基因组中                        其活性鉴定,这些技术包括染色质免疫共沉淀测
              的结合分布发生改变,通过招募与增强子形成相关                            序(chromatin immunoprecipitation sequencing,ChIP⁃

              的蛋白,形成新的增强子。在结直肠癌中,R273H                          seq),核酸酶靶向切割与释放(cleavage under targets
              突变型 p53 能够与 p65 直接相互作用并在 p65 反应                   and release using,CUT&RUN)以及利用转座酶检测
              元件处富集,促进新的增强子形成并响应肿瘤坏死                            染色质可及性测序(assay for transposase accessible
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