Page 112 - 南京医科大学学报自然科学版

第43卷第10期
·1438 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2023年10月

数据；EnhancerAtlas 数据库（http：//www.enhancerat⁃ enhancer transcription and eRNAs in cancer［J］. Cancer
las.org/） 能够提供人、小鼠、果蝇等 9 个物种的增 Res，2021，81（16）：4174-4182
［76］
强子注释；HACER 数据库（http：//bioinfo.vanderbilt. ［7］ NAPOLI M，WU S J，GORE B L，et al. ΔNp63 regulates a
［77］ common landscape of enhancer associated genes in non⁃
edu/AE/HACER/index.html） 可通过整合 GRO⁃seq
small cell lung cancer［J］. Nat Commun，2022，13（1）：
数据分析 eRNA 鉴定活性增强子。此外，RAEdb 数
614
据 库（http：//www.computationalbiology.cn/RAEdb/en⁃
［8］ LI Q，LV X，HAN C，et al. Enhancer reprogramming pro⁃
hancer.html）汇集了 MPRA 和 STARR⁃seq 数据，可用
motes the activation of cancer⁃associated fibroblasts and
于筛选具有调控活性的增强子。
breast cancer metastasis［J］. Theranostics，2022，12
7 展 望 （17）：7491-7508
［9］ FAGNOCCHI L，POLI V，ZIPPO A. Enhancer reprogram⁃
增强子作为增强基因表达的顺式调控元件，其 ming in tumor progression：a new route towards cancer
活性异常在恶性肿瘤发生和发展中的重要作用已 cell plasticity［J］. Cell Mol Life Sci，2018，75（14）：2537-
成为肿瘤研究领域的焦点之一。然而，尽管增强子 2555
研究在过去几十年中取得了显著进展，但这一领域 ［10］ PANIGRAHI A，O’MALLEY B W. Mechanisms of en⁃
仍有很多未知。例如，导致肿瘤基因组中增强子重 hancer action：the known and the unknown［J］. Genome
塑的因素有哪些？增强子重塑与肿瘤发生发展有 Biol，2021，22（1）：108
［11］ BALSALOBRE A，DROUIN J. Pioneer factors as master
何具体联系？增强子如何特异性地识别靶基因发
regulators of the epigenome and cell fate［J］. Nat Rev Mol
挥其调控功能？不同增强子之间如何相互协调，共
Cell Biol，2022，23（7）：449-464
同调节下游靶基因的表达？不同肿瘤组织中增强
［12］ ZHOU P，ZHANG Y，SETHI I，et al. GATA4 regulates de⁃
子调控活性异常的分子机制和生物学效应有何共 veloping endocardium through interaction with ETS1［J］.
性和特异性？eRNA转录本蕴藏的生物学功能究竟 Circ Res，2022，131（11）：e152-e168
有哪些？超级增强子是如何形成的？未来需要在 ［13］ BARRAL A，DÉJARDIN J. The chromatin signatures of
充分利用大数据和分子生物学技术的基础上，围绕 enhancers and their dynamic regulation［J］. Nucleus，
临床相关的增强子异常，利用体内模型开展深入的 2023，14（1）：2160551
研究，从而更好地阐述增强子相关的基础理论和临 ［14］ MOHANTA T K，MISHRA A K，AL⁃HARRASI A.The 3D
床问题，这将有助于基础研究向临床转化，更好地 genome：from structure to function［J］. Int J Mol Sci，
促进肿瘤治疗和干预。 2021，22（21）：11585
［15］ LIU N Q，MARESCA M，VAN DEN BRAND T，et al.
［参考文献］
WAPL maintains a cohesin loading cycle to preserve cell⁃
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of a beta⁃globin gene is enhanced by remote SV40 DNA 53（1）：100-109
sequences［J］. Cell，1981，27（2 Pt 1）：299-308 ［16］ SEE Y X，CHEN K J，FULLWOOD M J. MYC overexpre⁃
［2］ GILLIES S D，MORRISON S L，OI V T，et al. A tissue⁃ ssion leads to increased chromatin interactions at super⁃
specific transcription enhancer element is located in the enhancers and MYC binding sites［J］. Genome Res，2022，
major intron of a rearranged immunoglobulin heavy chain 32（4）：629-642
gene［J］. Cell，1983，33（3）：717-728 ［17］ GONG F R，SUN L，WANG Z D，et al. The BCL2 gene is
［3］ DAVIS C A，HITZ B C，SLOAN C A，et al. The encyclope⁃ regulated by a special AT⁃rich sequence binding protein 1⁃
dia of DNA elements（ENCODE）：data portal update［J］. mediated long range chromosomal interaction between the
Nucleic Acids Res，2018，46（D1）：D794-D801 promoter and the distal element located within the 3’⁃
［4］ SATTERLEE J S，CHADWICK L H，TYSON F L，et al. UTR［J］. Nucleic Acids Res，2011，39（11）：4640-4652
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successes of a comprehensive consortium［J］. Sci Adv， The 3D enhancer network of the developing T cell ge⁃
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