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第43卷第10期 汪徐春,孙玉洁. 增强子调控异常与恶性肿瘤的关系研究进展[J].
2023年10月 南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(10):1432-1440,1478 ·1433 ·
重塑包括新增强子的形成或原有增强子的消失,进 可通过凝集素复合物“挤压”形成柔性染色质环,使
而形成新的增强子分布 [7-8] 。此外,肿瘤细胞中原有 处于CTCF结合位点之间的增强子与靶基因启动子
增强子的活性也会异常升高或减弱。无论是增强 物理距离接近,再募集中介复合物促进增强子和启
子重塑还是原有增强子活性的异常,均有可能促进 动子接触,向启动子传递转录信号 [13] 。CTCF 和凝
癌基因的转录激活以及抑癌基因的异常失活,成为 集素还是拓扑关联结构域(topologically assocaited
肿瘤发生和发展的重要驱动因素。 domain,TAD)的重要组成部分。TAD 是染色质结
本文简述了增强子的结构特征、调控模式,在 构单元,平均大小约 1 Mb,能够限制染色质环的范
肿瘤发生和发展过程中增强子调控异常的形成机 围 [14] 。最近研究发现,远端增强子与靶基因启动
制、增强子鉴定的技术手段及常用数据库,这将有 子的染色质环是动态变化的。在小鼠胚胎干细胞
助于从一个不同的视角理解肿瘤发生发展的病理 中,凝集素释放因子 WAPL(WAPL cohesin release
机制,并为增强子的深入研究提供新视野。 factor)形成游离的蛋白库,通过循环的凝集素蛋白
与染色质的结合和释放介导增强子和启动子之间
1 增强子的结构特征
动态的相互作用 [15] 。而在骨肉瘤细胞中,增强子和
增强子是一段能显著增强靶基因转录效率的 启动子相互作用区域 MYC 的累积可以加强染色质
DNA 序列,长度 100~2 000 bp 。增强子具有特征 相互作用,增加染色质接触频率,进而驱动重塑致
[9]
性组蛋白修饰特征,依据修饰种类被分为 3 种状 癌染色质 [16] 。此外,本课题组研究发现,核基质结
态 [10] :①预激活状态,仅有 H3K4me1(H3 lysine 4 合蛋白SATB1可以介导BCL2基因3′⁃UTR内的增强
monomethylation)修 饰 ;② 活 性 状 态 ,既 包 含 子元件与 BCL2 基因启动子区的染色质环形成,通
H3K4me1 又存在 H3K27ac(H3 lysine 27 acetylation) 过上调BCL2基因表达调节细胞凋亡 [17] 。 SATB1还
修 饰 ;③ 静 止 状 态 ,同 时 存 在 H3K4me1 和 可通过形成启动子⁃增强子染色质环,调节参与T细
H3K27me3(H3 lysine 27 trimethylation)修饰。预激 胞发育的重要基因BCL6的表达 。
[18]
活和静止状态的增强子均无法发挥促进转录的作 近年来的研究发现,不仅启动子可以招募RNA
用,只有转变为活性状态才能发挥调控功能。 聚合酶Ⅱ(RNA polymeraseⅡ,RNAPⅡ)起始基因
增强子序列中含有不同转录因子的结合基序。 转录,部分活性增强子区域也能够募集 RNAPⅡ转
大多数转录因子结合在染色质开放区域,能够招募 录形成非编码 RNA 发挥调控作用,即增强子 RNA
增强子相关组蛋白修饰酶等改变增强子活性。有 (enhancer RNA,eRNA) 。eRNA序列通常小于200 bp,
[19]
些转录因子作为先驱转录因子在沉默的染色质区 非多聚腺苷酸化,具有半衰期短和不稳定的特点。
域结合,开放染色质后招募其他转录因子形成增强 由于 eRNA 能够促进增强子和启动子的相互作用,
子,调控胚胎发育和细胞分化等生物学过程 。 eRNA的表达水平与增强子的活性高度相关。如在
[11]
相当一部分增强子具有细胞特异性,只在特 雌二醇处理的乳腺癌细胞中,雌激素受体(estrogen
定细胞类型或细胞生长发育的特定阶段发挥调控 receptor,ER)反应性增强子转录的 eRNA 可与凝集
功能,这是由细胞中特异性的蛋白决定的。如心 素相互作用,稳定增强子与靶基因启动子之间形成
[20]
血管谱系特异性转录因子 GATA4(GATA bingding 的染色质环,上调靶基因表达发挥促癌作用 。
protein 4)作为先驱因子打开沉默的染色质区域, 增强子的活性受到众多因素影响,遗传变异、
募集 NKX2⁃5(NK2 homeobox 5)和 ETS1(ETS proto⁃ 表观修饰异常以及转录因子异常均可能造成增强
[12]
oncogene 1)形成对心脏发育至关重要的增强子 。 子的活性升高或者降低。此外,表观修饰异常以及
转录因子异常还能导致基因组中增强子的重塑,同
2 增强子的调控模式
时改变多个下游靶基因的表达水平,从而在肿瘤的
增强子通过与靶基因启动子形成染色质环结 发生和发展中发挥重要作用。
构上调靶基因表达。目前,已报道有多种关键因子
3 遗传变异改变增强子活性
参与染色质环的形成,如转录因子CCCTC结合因子
(CCCTC⁃binding factor,CTCF)、癌基因c⁃myc的产物 3.1 单核苷酸多态性(single nucleotide variants,SNP)
MYC 蛋白以及核基质结合蛋白 1(SATB homeobox 与增强子活性
1,SATB1)等。基因组中相距一定距离的两个CTCF 增强子序列的遗传变异包括单核苷酸多态性