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第43卷第4期 段伟豪,俞学成,吴璟斌,等. miR⁃27b⁃3p通过靶向SSRP1调控骨肉瘤细胞的生长[J].
2023年4月 南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(04):502⁃509 ·503 ·
骨肉瘤(osteosarcoma,OS)是人类最早发现的癌 recognition protein⁃1,SSRP1)小干扰RNA(si⁃SSRP1)
症之一,也是最常见的原发恶性骨肿瘤之一,但它 以及 SSRP1 过表达载体及其阴性对照载体均由上
仍是一种很罕见的恶性肿瘤 。骨肉瘤最常发生于 海吉玛公司设计并合成;Lipofectamine 3000 试剂
[1]
儿童及青少年中,常累及长骨干骺端,如股骨远端 (Invitrogen 公司,美国);CCK⁃8 试剂盒、辣根过氧化
与胫骨近端,且具有很强的肺转移倾向 。随着手 物酶标记的山羊抗兔二抗(上海圣尔生物);RIPA裂
[2]
术治疗的发展和多药化疗方案的引入,骨肉瘤患者 解液、BCA 蛋白定量试剂盒(杭州碧云天);细胞冻
的总生存率已经提升至60%~70%,但伴有转移和复 存液、ECL 发光液(苏州新赛美);结晶紫染液(北京
[3-4]
发的骨肉瘤患者的 5 年生存率仍仅约 20% 。而 索莱宝);PBS 缓冲液、TBS 缓冲液、电泳缓冲液、转
在过去的三十余年里,骨肉瘤患者的总体生存率达 膜缓冲液、4%多聚甲醛(武汉赛维尔);逆转录试剂
[5]
到了一个平台期 。因此,探寻骨肉瘤的发生发展 盒、实时荧光定量 PCR 试剂盒、蛋白胶预混液试剂
机制,找到有效的分子靶点是改善骨肉瘤患者预后 盒(南京诺唯赞);NucleoZOL 试剂(Macherey⁃Nagel
的当务之急。 公司,德国);GAPDH和SSRP1兔多克隆抗体(Abcam
微小 RNA(microRNA,miRNA)是一类内源性的 公司,英国)。
非编码小分子RNA,大小约为18~25个核苷酸,其主要 1.2 方法
功能是识别靶基因的 3′非编码区(3′⁃untranslated 1.2.1 细胞培养、转染
region,3′⁃UTR)中的互补靶点,在转录之后抑制靶 U⁃2OS 及 MG63 细胞株选用 McCoy’s 5A 培养
[6]
基因的表达或者促进靶基因的降解 。miRNA已被 基 ,143B 和 MG63 细 胞 株 选 用 MEM 培 养 基 ,
证明参与肿瘤的各种生物过程,如增殖、凋亡、侵袭、 hFOB1.19选用DMEM培养基,均辅以10%的胎牛血
转移、自噬和血管生成等 [7-10] 。大量研究发现,miR⁃ 清及1%的青链霉素。人骨肉瘤细胞株均在37 ℃含
NA 在调节骨肉瘤增殖、迁移、凋亡等方面发挥了关 5% CO2的湿润气体的培养箱中培养,成骨细胞株在
键作用,并与骨肉瘤的预后及耐药密切相关,具有 34.5 ℃含5% CO2的湿润气体的培养箱中培养。
成为骨肉瘤的新型候选生物标志物的潜力 [11-14] 。越 以上细胞每2 d更换1次细胞培养液,在细胞密
来越多的证据表明,miR⁃27b⁃3p在肿瘤组织中表达 度达到80%时使用胰酶进行消化与传代。转染48 h
下调 [15] ,并作为一种肿瘤抑制因子调节肿瘤进展, 后取适量对数生长期的细胞进行铺板,当孔内细胞
包括细胞增殖、侵袭、转移等方面 [16-18] 。同时,也有研 密度达到70%~90%时进行质粒转染,转染方法按照
究证明了 miR⁃27b⁃3p 可能作为一种致癌 miRNA 促 Lipofectamine 3000提供的方法进行。
[19]
进乳腺癌的生长 。这些研究的发现说明miR⁃27b⁃ 1.2.2 GEO数据库分析
3p可能具有多方面的作用,可能与特定的肿瘤类型 GSE65071 数据集从 GEO 数据库(http://www.
或者具体的靶基因有关。然而,miR⁃27b⁃3p在骨肉 ncbi.nlm.nih.gov/geo)获取,使用R语言limma包分析
瘤中的生物学功能尚未被研究。 并筛选该数据集中正常样本与骨肉瘤样本的差异
本研究旨在探寻骨肉瘤中差异表达的miR⁃27b⁃3p 表达的 miRNA[标准为 log2 差异倍数(fold change,
在骨肉瘤发生发展中的表达情况、生物学功能以及 FC)≥ 1 且调整后的 P < 0.05],分别运用 R 语言的
潜在的分子机制,从而为骨肉瘤的治疗提供新的思 ggpubr 和 pheatmap 包对差异 miRNA 绘制火山图及
路和靶点。 热图。GSE65071 数据集中包括 35 例样本,其中
20 例骨肉瘤样本为肿瘤组,15 例健康者样本为对
1 材料和方法
照组。
1.1 材料 1.2.3 实时荧光定量PCR(RT⁃qPCR)
人骨肉瘤细胞株U⁃2OS、143B、MG63、MNNG⁃HOS 使用上述转染48 h的细胞,根据厂商提供的说
以及人成骨细胞系 hFOB1.19 购自中国科学院上海 明使用 NucleoZOL 试剂进行细胞总 RNA 的抽提。
生命科学研究所细胞库。MEM、DMEM、McCoy’s 使用酶标仪(BioTek公司,美国)测定总RNA的浓度
5A培养基、胰酶、青链霉素(双抗)(上海源培生物); 及纯度。取 1 000 ng RNA 使用逆转录试剂盒,按照
胎牛血清(Gibco 公司,美国);miR⁃27b⁃3p 模拟物 10 μL 的体系配方进行 cDNA 合成,反应条件为
(miR⁃27b⁃3p mimics)、miR⁃27b⁃3p对照载体(mimics 42 ℃ 30 min,95 ℃ 5 min,5 ℃ 5 min,获得的 cDNA
control)、结构特异性识别蛋白 1(structure⁃specific 置于-20 ℃保存。使用实时荧光定量 PCR 试剂盒、