Page 30 - 南京医科大学学报自然科学版
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第43卷第5期
·612 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2023年5月
乳腺癌(breast cancer,BCa)是全球范围内女 诺唯赞)逆转录为cDNA,然后对目的基因进行qRT⁃
性最常见的恶性肿瘤,复发和转移是导致乳腺癌患 PCR扩增(SYBR Green Ⅰ,上海翊圣)。所用引物序
者治疗失败的主要原因 [1-2] 。尽管近年来乳腺癌的诊 列 为 :β ⁃ actin 上 游 引 物 5′ ⁃ AGATGTGATCAG⁃
断和治疗手段已经取得了巨大进步,但乳腺癌的发病 CAAGCAG⁃3′,下游引物5′⁃GCGCAAGTTAGGTTTT⁃
率仍高居不下,其发病机制尚未完全阐明。 GTCA ⁃ 3′ ;人 RP11 ⁃ 490M8.1 上 游 引 物 5′ ⁃ CTCT⁃
长链非编码RNA(long non⁃coding RNA,lncRNA) GCTTTCTGTGCCAAGG⁃ 3′,下游引物 5′⁃AAACC⁃
是一类长度超过200个核苷酸的非编码RNA。大量 CACCACT⁃TTTGTCCG⁃3′。
研究表明,lncRNA 在多种肿瘤中异常表达,并通过 1.2.2 细胞转染及稳转细胞构建
多种机制参与包括乳腺癌在内的肿瘤发生发展过 RP11⁃490M8.1 表 达 质 粒 为 本 实 验 室 构 建 ,
程 [3-5] 。例如,lncRNA TTN⁃AS1 通过调控 miR⁃139⁃ RP11⁃490M8.1 ASO 及其对照(广州锐博),按照
5p/ZEB1轴促进乳腺癌细胞的增殖、侵袭和上皮⁃间 Lipofectamine 2000(Thermo Scientific 公 司 ,美 国)
质转化(epithelial⁃mesenchymal transformation,EMT) 说明书进行质粒或 ASO 转染。RP11⁃490M8.1 表
;lncROPM 通过调控 PLA2G16 的 mRNA 稳定性上 达质粒及其对照质粒转染 MDA⁃MB⁃231 和 MCF⁃7
[6]
调其表达,激活 PI3K/AKT、Wnt/β⁃catenin 和 Hippo/ 细胞后,用嘌呤霉素进行稳转细胞的筛选并用
[7]
YAP信号通路,进而维持乳腺癌干细胞的干性 ;ln⁃ qRT⁃PCR 进行过表达效率的验证。
cRNA AY343892 通过与 BRCA1 结合促进 PTEN 的 1.2.3 CCK8实验
转录,进而抑制乳腺癌的进展 。然而,lncRNA的 将细胞接种于96孔细胞培养板,用Opti⁃DMEM
[8]
数目众多、作用机制复杂,其在乳腺癌发生发展中 配制10%CCK8试剂(上海翊圣),在细胞贴壁后的0、
的作用和机制有待进一步深入挖掘。 24、48、72 和 96 h 分别加入 0.1 mL CCK8 试剂,放入
RP11⁃490M8.1 是本课题组在 Gene Expression 37 ℃细胞培养箱中避光孵育 1~2 h,然后用酶标仪
Omnibus(GEO)数据库中筛查发现的在乳腺癌组织 于 450 nm 处检测吸光度值,用 GraphPad 软件进行
中显著下调的一条lncRNA,目前尚未有关于RP11⁃ 分析并作图。
490M8.1 在乳腺癌发生发展中的作用及机制的报 1.2.4 克隆形成实验
道。本研究检测 RP11⁃490M8.1 在乳腺癌组织和癌 将细胞按 100 个/孔接种于 6 孔板中,培养 14 d
旁组织中的表达情况,并初步研究其对乳腺癌细胞 左右加入 5 mL 4%多聚甲醛,在 4 ℃冰箱中固定
增殖的影响。 15 min 后弃去多聚甲醛,使用结晶紫染色 10~30
min,将染色液用PBS洗净后室温干燥、拍照,然后进
1 材料和方法
行计数统计。
1.1 材料 1.3 统计学方法
乳腺癌组织及癌旁组织取自南京医科大学第 用 GraphPad Prism 5.0 软件和 One⁃way ANOVA
一附属医院乳腺外科,患者未接受过局部或全身治 检验进行实验结果分析,所有数据以均数±标准差
疗且经病理学诊断为乳腺癌。本研究经南京医科 (x ± s)。RP11⁃490M8.1表达水平与临床病理参数的
大学伦理委员会批准[南医大伦理(2022)492 号], 关系采用χ 检验,生存分析采用Kaplan⁃Meier 检验,
2
标本的获取征得患者知情同意。 Cox多因素回归分析,P<0.05为差异有统计学意义。
人乳腺癌细胞系MCF⁃7和MDA⁃MB⁃231来源于
2 结 果
美国 ATCC。所有细胞均使用含有 10%胎牛血清
(FBS)、100 U/mL 青霉素和 100 μg/μL 链霉素的 2.1 RP11⁃490M8.1在乳腺癌组织中表达下调
DMEM(Gibco 公司,美国)培养基,并在含有 5% 通过 GEO 数据库(GSE29431)分析了人乳腺癌
CO2的 37 ℃细胞培养箱中进行培养。 及癌旁组织中差异表达的lncRNA。对这些差异表达
1.2 方法 的lncRNA进一步筛选发现,RP11⁃490M8.1在乳腺癌
1.2.1 qRT⁃PCR 组织中表达显著下调(图 1A)。利用 Web server for
用 TRIzol 试剂(大连宝生物)提取乳腺癌组织、 Coding Potential Assessing Tool 预测了RP11⁃490M8.1
癌旁组织以及乳腺癌细胞的总RNA,将RNA按照试 的蛋白编码能力,结果显示RP11⁃490M8.1不具有蛋
剂商提供的说明书(Reverse Transcription Kit,南京 白编码能力(图1B)。用qRT⁃PCR检测了36对乳腺