Page 49 - 南京医科大学自然版

第45卷第10期 南京医科大学学报（自然科学版）
2025年10月 Journal of Nanjing Medical University（Natural Sciences） ·1417 ·

·基础研究·

肥胖相关基因 Stambpl1 的生物信息学筛选及其对脂代谢影响

的初步探究

任 钰，李超普，张 许，季学涛，李 仲 *

南京医科大学罕见代谢性疾病研究重点实验室，生物化学与分子生物学系，江苏省代谢性疾病分子靶标与干预重点实验室，江
苏 南京 211166

［摘 要］ 目的：利用生物信息学方法筛选肥胖相关基因，并初步探究其对脂肪细胞脂代谢的影响。方法：从基因表达综合数
据库（Gene Expression Omnibus，GEO）中获取 C57BL6/J 小鼠白色脂肪组织（white adipose tissue，WAT）数据集 GSE30247、
GSE37218和GSE138632。将普通饮食喂养的小鼠转录组数据设为对照组，高脂饮食（high fat diet，HFD）喂养的小鼠转录组数据设
为实验组，使用NCBI官方的GEO2R工具分别筛选GSE37218和GSE30247在HFD后的差异基因，以P < 0.05，log2FC > 1.5为筛选标
准，获取二者的共同差异基因。对差异基因进行基因本体（gene ontology，GO）、哺乳动物表型本体（mammalian phenotype ontology，
MP）和人类表型本体（human phenotype ontology，HPO）富集分析。采用 STRING 数据库构建蛋白质相互作用（protein⁃protein
interaction，PPI）网络，使用Cytoscape筛选并获取核心基因（hub gene）。对GSE138632数据集中对照组和实验组数据进行差异
分析并通过受试者工作特征（receiver operating characteristic，ROC）曲线进行基因预测诊断性分析，进一步验证hub gene。利用
慢病毒构建STAM结合蛋白样1（STAM binding protein like 1，Stambpl1）稳定过表达的3T3⁃L1细胞系，使用油酸（oleic acid，OA）
诱导3T3⁃L1细胞中脂滴积累，通过BODIPY染色和甘油三酯含量检测判断脂滴累积情况。结果：对GSE37218和GSE30247数
据集进行差异分析，发现HFD喂养后小鼠附睾脂肪组织（epididymal white adipose tissue，eWAT）中较普通饮食喂养小鼠eWAT
共同上调的基因 57 个；通过 Cytoscape 中的多种算法分析进一步得到 13 个 hub gene；使用 GSE138632 数据集验证这 13 个 hub
gene 的表达，最终筛选出Stambpl1，RT⁃PCR 实验结果显示Stambpl1在HFD 诱导的肥胖小鼠脂肪组织表达升高；BODIPY 染色
和甘油三酯含量检测表明在3T3⁃L1细胞中过表达Stambpl1可缓解OA诱导的脂滴累积。结论：本研究利用生物信息学技术筛
选得到肥胖相关基因Stambpl1，并初步证实Stambpl1会在体外抑制脂肪细胞的脂质积累。
［关键词］ 肥胖；GEO数据库；Stambpl1；油酸
［中图分类号］ R589.2 ［文献标志码］ A ［文章编号］ 1007⁃4368（2025）10⁃1417⁃11
doi：10.7655/NYDXBNSN250557

Bioinformatics screening of obesity ⁃ related gene Stambpl1 and preliminary study of its
effects on lipid metabolism

REN Yu，LI Chaopu，ZHANG Xu，JI Xuetao，LI Zhong *
Key Laboratory of Rare Metabolic Disease，Department of Molecular Biology and Biochemistry，Nanjing Medical
University，Jiangsu Provincial Key Laboratory of Molecular Targets and Intervention for Metabolic Diseases，Nanjing
211166，China

［Abstract］ Objective：Bioinformatics methods were used to screen obesity⁃related genes and preliminarily explore their effects on
adipocyte lipid metabolism. Methods：We obtained the C57BL6/J mouse white adipose tissue（WAT）datasets GSE30247，GSE37218，
and GSE138632 from the Gene Expression Omnibus（GEO）. The transcriptome data of mice fed with a normal diet in GSE37218 and
GSE30247 were set as the control group，and the transcriptome data of mice fed with a high⁃fat diet（HFD）were set as the experimental
group. The NCBI official GEO2R tool was used to screen the differential genes of the two datasets after HFD，and P < 0.05，log2FC>1.5
were used as the screening criteria to obtain the common differential genes of the two datasets. Perform gene ontology（GO），

［基金项目］ 国家自然科学基金（92357307，32130050，32201064）；江苏省高等学校基础科学（自然科学）研究（23KJB310005）
通信作者（Corresponding author），E⁃mail：lizhong@njmu.edu.cn（ORCID：0000⁃0003⁃4991⁃9563）
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