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第45卷第10期
·1420 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2025年10月
调整阈值并去除背景光后输出参数图。 文献发现,Stambpl1、Slc15a3、Myo1f、Top2a、Mki67、
使用普利来酶法试剂盒对 TG 含量进行检测, Atp6v0d2这6个核心基因在脂代谢领域尚无相关报
使用细胞裂解液将细胞刮下后室温静置 10 min,将 道,因此后续对这6个基因进行分析。
裂解液分为两部分,一部分经高速离心后利用BCA 2.3 数据库验证hub gene的表达
蛋白浓度试剂盒检测浓度,另一部分经70 ℃加热后 在 GSE138632 数据集中验证 hub gene 的表达,
检测TG含量。最后使用蛋白浓度校准TG含量。 结果发现,Stambpl1 在 HFD 后升高最显著(图 3A)。
1.3 统计学方法 接着,通过 ROC 曲线分析预测 hub gene 在 HFD 诱
所有计量数据均使用 GraphPad Prism 软件分 导肥胖发生中的诊断价值,结果显示 Stambpl1 的
析,定量数据用均数±标准误((x ± sx))进行描述,两 ROC 曲线下面积(area under the curve,AUC)最大,
组数据比较采用双尾t检验,P < 0.05为差异有统计 表明 Stambpl1 对肥胖的发生发展有较好的预测能
学意义。 力(图3B)。
HFD 诱导的肥胖小鼠 eWAT 中脂肪分解相关
2 结 果
基因表达降低,而 iWAT 中脂肪分解和脂肪生成相
2.1 差异基因筛选及富集分析 关基因的表达水平升高 [13] 。实验结果显示在 HFD
利用在线工具 GEO2R 对数据集 GSE37218 中 后,围脂滴蛋白 1(perilipin 1,Plin1)在 eWAT 中降
HFD 小鼠的 eWAT 芯片数据和普通饮食小鼠的 低而在 iWAT 中升高,与前期文献报道一致。此
eWAT 芯片数据进行差异分析,共获得 HFD 后上 外,Stambpl1在HFD诱导的肥胖小鼠eWAT和iWAT
调的差异基因 532 个,下调的差异基因 495 个;同 中表达均明显升高(图3C)。因此,Stambpl1可能作
样对 GSE30247 数据集进行差异分析,共获得 HFD 为肥胖相关基因,在肥胖的发生发展中发挥一定的
后 上 调差异基因 1 094 个,下调差异基因 707 个 作用。
(图 1A)。以 P < 0.05、log2FC>1.5 为筛选标准,获得 2.4 稳定过表达Stambpl1的3T3⁃L1细胞株构建
GSE37218 和 GSE30247 数据集中共同上调的基因 将 PCR 扩增产物和酶切后的载体进行同源重
57 个(图 1B)。将这些差异基因进行 GO 富集,结果 组连接,连接产物转化涂板后挑取单菌落进行扩增
显示在HFD 诱导的小鼠eWAT 中,上调基因与白细 和测序,测序结果显示过表达载体构建成功。 将过
胞、巨噬细胞等炎症发生相关(图 1C)。MP 和 HPO 表达载体包装成慢病毒后感染3T3⁃L1细胞,细胞经
富集结果也显示上调的差异基因与免疫炎症相关 嘌呤霉素筛选后收样,检测 Stambpl1 过表达效率,
(图1D)。 结果显示Stambpl1表达显著升高(图4)。
多项研究证实,脂肪组织的慢性轻度炎症不仅 2.5 过表达 Stambpl1 抑制 3T3⁃L1 细胞中 OA 诱导
与肥胖人群的代谢性疾病及相关并发症的发生相 的脂质累积
关,而且脂肪组织炎症的发生还会对机体远端器官 为了探究 Stambpl1 在脂肪细胞中的功能,使用
功能产生负面影响 [12] 。本研究表明在HFD诱导后, 300 μmol/L OA 处理 3T3⁃L1 细胞以诱导脂质累积,
小鼠脂肪组织中上调的基因与炎症的发生具有相 然后使用荧光染料进行细胞器染色。Hoechst 是一
关性。 种 可 以 与 细 胞 中 DNA 特 异 性 结 合 的 染 料 [14] 。
2.2 PPI网络的构建及hub gene的筛选 Hoechst染色成功定位了 3T3⁃L1的细胞核;BODIPY
将差异基因导入 STRING12.0 数据库后初步构 具有亲脂性,是针对脂滴的小分子探针 [15] ,BODIPY
建PPI网络。将构建的PPI网络导入Cytoscape10.3.2 脂滴染色结果显示,过表达 Stambpl1 的 3T3⁃L1 细
中以 Closeness Centrality 为标准进一步绘制 PPI 网 胞脂滴数量少于对照组细胞(图 5A)。对荧光强
络图(图2A),使用CytoHubba插件来筛选hub gene, 度的定量分析结果同样表明过表达 Stambpl1 的
为了提高可信度,使用 CytoHubba 中的 BottleNeck、 3T3⁃L1细胞内脂滴数量低于对照组细胞(图 5B)。
Betweenness 和 Stress 3 种算法分别获取得分最高的 同时检测了 3T3⁃L1 细胞中 TG 含量,结果表明过
20个基因(图2B)。之后将3种算法获得的hub gene 表达 Stambpl1 的 3T3⁃L1 细胞与对照组细胞相比,
取交集,最终得到 Ccr5、Gpnmb、Timp1、Itgax、Ubd、 细胞内 TG 含量明显降低(图 5C)。以上结果表明,
Lcp1、Atf3、Stambpl1、Slc15a3、Myo1f、Top2a、Mki67、 Stambpl1 可以抑制 3T3⁃L1 细胞中 OA 诱导的脂质
Atp6v0d2 这 13 个 hub gene(图 2C、D)。进一步检索 累积。

