Page 50 - 南京医科大学自然版
P. 50

第45卷第10期
               ·1418 ·                           南 京    医 科 大 学 学         报                        2025年10月


              mammalian phenotype ontology（MP），and human phenotype ontology（HPO）enrichment analysis on differentially expressed genes.
              Construct protein ⁃ protein interaction（PPI）networks using STRING database，screen and obtain hub genes using Cytoscape. The
              transcriptome data of mice fed with normal diet in the GSE138632 dataset were set as the control group，and the transcriptome data of
              mice fed with HFD were set as the experimental group for differential analysis. Gene predictive diagnostic analysis was performed
              using receiver operating characteristic（ROC）curve to further validate hub genes. Using lentivirus to construct a stable overexpressed
              3T3⁃L1 cell line with STAM binding protein like 1（Stambpl1），oleic acid（OA）was used to induce lipid droplet accumulation in 3T3⁃L1
              cells.；BODIPY staining and triglyceride（TG）content detection were used to determine lipid droplet accumulation. Results：After
              performing differential analysis on the GSE37218 and GSE30247 datasets，we found 57 genes were commonly upregulated in the
              epididymal white adipose tissue（eWAT）of mice fed withHFD compared to those fed with normal diet. Further analysis using multiple
              algorithms in Cytoscape identified 13 hub genes. The expression of these 13 hub genes was validated using the GSE138632 dataset，
              leading to the screening of Stambpl1. RT⁃PCR results showed that Stambpl1 was upregulated in the adipose tissue of HFD⁃induced
              obese mice. BODIPY staining and TG content assays revealed that overexpression of Stambpl1 in 3T3⁃L1 cells alleviated OA⁃induced
              lipid droplet accumulation. Conclusion：This study used bioinformatics to screen the obesity⁃related gene Stambpl1，and preliminarily
              confirmed that Stambpl1 inhibits lipid accumulation in adipocytes in vitro.
             ［Key words］ obesity；GEO database；Stambpl1；oleic acid
                                                                      ［J Nanjing Med Univ，2025，45（10）：1417⁃1426，1466］





                  肥胖是全球性的公共卫生问题，已成为主要的                          在 线 分 析 软 件 GEOR2 分 析 小 鼠 附 睾 脂 肪 组 织
              非传染性疾病风险因素之一。据研究估计，成人超                           （epididymal white adipose tissue，eWAT）在HFD后的
              重和肥胖（定义为成人体重指数 ≥ 25 kg/m ）比例预                     差异表达基因。对eWAT中共同的上调差异基因进
                                                    2
              计将从 2020 年的 38%（约 26 亿人）上升到 2035 年                行功能和表型的富集分析，并构建蛋白质相互作用
                                ［1］
              的 50%（约 40 亿人） 。肥胖是一种成因复杂的疾                      （protein⁃protein interaction，PPI）网络，利用Cytoscape
              病，主要与营养摄入过多而运动量不足等不健康的                            软件分析网络中的核心基因（hub gene）。进一步在
              生活方式及遗传和生物等因素相关 。研究证明，肥                           HFD后的小鼠腹股沟脂肪组织（inguinal adipose tissue，
                                             ［2］
              胖是诱发心脑血管疾病、高胰岛素血症、动脉粥样硬                           iWAT）数据集中验证 hub gene 的表达，获得同时在
              化、胰岛素抵抗和各种癌症的主要危险因素 。肥                            肥胖小鼠 eWAT 和 iWAT 两种脂肪库中都显著上调
                                                      ［3］
              胖的特征是体重增加并伴有脂肪过度堆积，白色脂                            且有较好临床预测性的 STAM 结合蛋白样 1（STAM
              肪组织（white adipose tissue，WAT）是这一过程发生              binding protein like 1，Stambpl1）基因。体外细胞实
              的最主要部位，脂肪组织的扩增是脂肪细胞增生和                            验表明，过表达 Stambpl1 可缓解脂肪细胞中油酸
                            ［4］
              肥大的共同结果 。                                        （oleic acid，OA）诱导引起的脂滴累积，提示Stambpl1
                  肥胖具有异质性，并缺乏有效的生物检测标志                          可能在脂代谢中发挥作用。
                           ［5］
              物和治疗方法 。此外，与肥胖相关的重要基因及
                                                                1 材料和方法
              其作用机制尚未完全阐明，因此深入了解肥胖发生
              的遗传机制是必要的。生物信息学技术通过分析                             1.1  材料
              体征指标、基因遗传特征等大规模生物数据，能深                                 3T3⁃L1细胞、人胚肾293T细胞（human embryonic
              入解析疾病的分子遗传机制，发现诊断标志物与治                            kidney 293 cell，HEK⁃293T）（中国科学院细胞库）；
              疗靶点，进而推动基因诊疗等个性化精准医疗的发                            DMEM 高 糖 细 胞 培 养 基 、胎 牛 血 清（fetal bovine
                ［6］
              展 。针对代谢性疾病，通过多组学数据分析能发                            serum，FBS）（Gibco公司，美国）；PEI转染试剂（Med⁃
              现肥胖发生发展的相关潜在标志物，助力疾病的早                            ChemExpress 公司，美国）；EcoRⅠ限制性内切酶
              期诊断、病情监测及治疗效果评估               ［7-8］ 。            （TaKaRa 公司，日本）；逆转录试剂盒、同源重组酶

                  本研究利用基因表达综合数据库（Gene Expres⁃                  （南京诺维赞）；组织细胞甘油三酯（triglyceride，
              sion Omnibus，GEO）分析了高脂饮食（high fat diet，           TG）酶法测定试剂盒（北京普利莱）；聚凝胺感染/转
              HFD）诱导的小鼠 WAT 相关基因芯片数据集。首                         染试剂（Sigma⁃Aldrich 公司，美国）；Hoechst 核酸染
              先，以 P < 0.05、log2FC > 1.5 作为筛选标准，使用               料 、氟 硼 二 吡 咯（boron ⁃ dipyrromethene，BODIPY）
   45   46   47   48   49   50   51   52   53   54   55