Page 54 - 南京医科大学自然版
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第45卷第10期
               ·1422 ·                           南 京    医 科 大 学 学         报                        2025年10月


                                       A
                                                        Cd300c2  Cd52  Ncan
                                                     Gpnmb           Ccr5
                                                  I17r                  Atp6v0d2
                                                           Tlr1 Rgs1
                                                        Lat2       VgIl3
                                              Arhgap25                     Myo1f
                                                    Clec4b1           Slamf8
                                             Ccna2                           Itgb2
                                                 Slc5a7      Timp1       Tnc
                                                         Prc1    Top2a
                                           Adam8                             Coll2a1
                                                 Sfrp5                    F7
                                                       Stambpl1   Ubash3b
                                            Itgax                             Atf3
                                                  Ubd                   Cd300ld
                                                         Slc37a2  Spc25
                                                             Nuf2
                                             Ccl2  Tpx2                Fgf13  Cd200r1
                                               Cd44  Myole          Tfpi2  Paqr9
                                                         Saa3  Lipf  Ptpre
                                                  Mrc2                  Dock8
                                                    Col6a3           Cd84
                                                        Mki67 Slc15a3  Lcp1
                B            BottleNeck                   Betweenness
                                                                                           Stress
                            Ncan  Atp6v0d2                  Gpnmb
                                                                                          Atp6v0d2
                       Gpnmb           Tlr1                          Cd52
                                                      I17r                           Ccr5        Myo1f
                               Ccr5                      Timp1  Top2a
                                                                                         Ubd  Itgax
                    Ubd                 Col12a1
                          Itgax     Top2a                    Cc12
                                                                         Ccr5    Cd52                 Atf3
                                                 Ccna2 Itgax         Atf3           StambpCd44 Cc12 Timp1
                              Timp1                      Mki67  Cd44
                  Stambpl1                Atf3
                         Mki67      Myo1f                                                  Itgb2
                                                             Itgb2              Gpnmb
                                                       Ubd         Lcp1               Mki67     Top2a  Lcp1
                               Lcp1                                    Atp6v0d2
                     Tpx2                Tnc       Adam8                                   Slc15a3
                                                            Slc15a3
                                                                                    Ccna2         Ptpre
                         Slc37a2   Slc15a3
                               Lipf                     Stambpl1  Myo1f                    Adam8
                C                                      D
                                                              Gene symbol           Gene description
                                                              Ccr5             C⁃C motif chemokine receptor 5
                                                              Gpnmb           Glycoprotein(transmembrane)nmb
                BottleNeck                   Betweenness
                                                              Timp1          Tissue inhibitor of metalloproteinase 1
                                  0
                          7                1                  Itgax                 Integrin alpha X
                                                              Ubd                    Ubiquitin D
                                                              Lcp1             Lymphocyte cytosolic protein 1
                                  13
                                                              Atf3             Activating transcription factor 3
                             0          6                     Stambpl1          STAM binding protein like 1
                                                              Slc15a3         Solute carrier family 15 member 3
                                                              Myo1f                   Myosin IF
                                                              Top2a            Topoisomerase(DNA)Ⅱ alpha
                                  1
                                                              Mki67       Antigen identified by monoclonal antibody Ki⁃67
                                                                                +
                                 Stress                       Atp6v0d2   ATPase,H transporting,lysosomal V0 subunit D2
                 A:Using Cytoscape software to draw differential gene PPI networks based on Closness Centrality as the standard. B:Using CytoHubba’s Bottle⁃
              Neck,Betweenness,and Stress algorithms to obtain the top 20 hub genes respectively. C:Using Venn diagram to obtain common hub genes for three
              algorithms. D:The names of the 13 common hub genes.
                                               图2 使用Cytoscape筛选核心枢纽基因
                                          Figure 2  Screening core hub genes using Cytoscape
              白质或组织阵列、高通量核酸测序和RT⁃PCR等                   [19] 。  脂肪库中免疫细胞组成的差异                [20-21] 。哺乳动物体
              本研究利用了其中的微阵列数据和高通量表达数                             内主要有皮下脂肪和内脏脂肪两大白色脂肪库,这
              据来筛选HFD 之后eWAT 表达升高的基因,最终获                        两大脂肪库的功能都与机体代谢和肥胖发生密切
              得了57个显著上调的差异基因。                                   相关,但在能量调节与释放、肥胖诱发机制等方面
                  研究表明,小鼠和人类具有不同的 WAT 库,而                       又有许多不同。研究表明,小鼠体内的 eWAT 与炎
              不同的 WAT 库具有不同的代谢功能。这一方面是                          症的产生和胰岛素抵抗相关             [22-23] ,而iWAT则具有优
              由于脂肪细胞内在的差异,另一方面也归因于不同                            先储存脂质的功能,是膳食来源脂质的主要生理储
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