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第45卷第11期        汪佰成,倪晶怡,刘馨月,等. 广谱中和新型冠状病毒及其变体的纳米抗体制备及功能研究[J].
                 2025年11月                    南京医科大学学报(自然科学版),2025,45(11):1598-1607                      ·1601 ·


                行 PCR 分析,结果显示细菌文库阳性率为 95.83%                      列。通过Clustal Omega对48个序列进行系统发育树
               (图1D)。随后通过细菌文库及辅助噬菌体初步构建                           分析(图2B),此举为筛选中和Nb提供了更多选择和
                出噬菌体文库,效价为1.64×10 pfu/mL。这些结果                     潜在的候选对象。由于互补决定区3(complementarity
                                            12
                表明,本研究建立了一个靶向WT⁃RBD的Nb文库。                         determining region 3,CDR3)序 列 的 多 样 性 ,选 择
                2.2  利用Delta⁃RBD筛选Nb                              Nb34、Nb42、Nb45和Nb48作为Delta⁃RBD 的结合抗
                    使用Delta⁃RBD 对噬菌体文库进行免疫管筛选                     体进行进一步研究。
                和单菌落 ELISA 从而筛选出靶向 Delta⁃RBD 的 Nb。                2.3  Nb的表达、纯化和鉴定
                经过3轮富集,噬菌体文库逐渐扩增200倍。随后,通                             考虑到将来的应用范围、生产成本和大规模生
                过2轮ELISA从192个随机克隆中选择出125个结合                       产可能性,选择毕赤酵母系统进行表达。用Ni⁃NTA
                率>3的阳性克隆(图2A)。对所有阳性克隆菌落进行                         蛋白琼脂糖高速纯化树脂纯化诱导表达出的 Nb。
                测序并进行比对,去除重复序列,得到48个不同的序                          SDS⁃PAGE 分析显示,纯化的 Nb34、Nb42、Nb45 和


                   A          M RNA                B            Oligo dT primer        Random 6⁃mer
                                                           M   1  2   3   4   5   M  1   2   3   4   5  (μL)

                                                    (bp)
                                                    2 000—
                     (bp)
                     2 000—          ←28S           1 000—                                             —900 bp
                     1 000—          ←18S             750—                                             —600 bp
                      750—                            500—
                      500—                            250—
                      250—           ←5S
                      100—                            100—



                       C                 Oligo dT primer                       Random 6⁃mer
                        (bp)  M      0.1   0.2   0.3   0.4   0.5   M     0.1   0.2   0.3  0.4   0.5  (μL)
                         2 000—
                         1 000—
                          750—
                          500—
                                                                                                     —400 bp
                          200—
                          100—

                         D
                          (bp) M       1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11  12  13  14  15  16
                           2 000—
                           1 000—
                            500—                                                                       —400 bp
                            200—
                            100—

                          (bp)
                           2 000—
                           1 000—
                            500—
                            200—                                                                       —400 bp
                            100—



                          (bp)
                           2 000—
                           1 000—
                            500—
                            200—                                                                       —400 bp
                            100—
                   A:The electrophoresis results verified the quality and purity of the total RNA. B:In the first round of PCR amplification,gel electrophoresis
                showed clear bands of cDNA templates amplified by two primers. C:In the second round of PCR amplification,gel electrophoresis was performed using
                different amounts of cDNA templates. D:Among the 48 screened clones,the positive rate was 95.83%. M:marker.
                                                 图1   建库过程中部分凝胶电泳结果图
                                  Figure 1  Results of partial agarose gel electrophoresis during library building
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