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第45卷第11期
               ·1604 ·                           南 京    医 科 大 学 学         报                        2025年11月


                            表1 BLI验证亲和力                         SARS⁃CoV⁃2及其变体的中和Nb。
                       Table 1 BLI verification of affinity     2.6  分子对接分析
                     Name              KD(x ± s)        R 2          为了直观地评估4种Nb的广泛中和作用,使用
                                         -7
                Omicron⁃RBD+Nb34  2.118×10 ± 1.801×10 -8  0.932
                                                                AlphaFold2 等工具来构建分子模型,并将抗原与抗
                                         -8
                Omicron⁃RBD+Nb42  5.349×10 ± 3.575×10 -9  0.892
                                                                体对接。图 5 显示了每个 Nb 与 SARS⁃CoV⁃2 原始
                                         -7
                Omicron⁃RBD+Nb45  5.974×10 ± 3.877×10 -8  0.892
                                                                株、Delta 变体和 Omicron 变体之间的相互作用。其
                     A                                                  B
                          Pseudovirus Omicron strain  Pseudovirus+50 μmol/L Nb45         *
                                                                            (%)  150  *  *
                                                                            Relative activity  50
                                                                            100



                                                                              0
                                                                                Blank  100 μmol/L
                                                                                  50 μmol/L
                                                                                         200 μmol/L
                        Pseudovirus+100 μmol/L Nb45  Pseudovirus+200 μmol/L Nb45







                 A:The green in the fluorescence image indicates the Omicron pseudovirus,and the blue represents 293T cells. B:The bar graph shows that com⁃
                                                                            *
              pared with the blank control,Nb45 prevents the entry of the Omicron pseudovirus into 293T cells. P < 0.05,n=3).
                                            图5 Nb45阻止Omicron假病毒进入293T细胞
                                    Figure 5 Nb45 prevents Omicron pseudovirus entry into 293T cells

              中,红色标记表示Nb位点,蓝色标记表示RBD位点                          力,并证实Nb45具有中和Omicron 变体假病毒的能
             (图 6A)。进一步分析显示,预测的结合位点均属                           力。此外,本研究还证明了这4 种Nb具有较高的热
              于保守位点,这就证明了 4 种Nb对SARS⁃CoV⁃2及                     稳定性和 pH 稳定性。通过预测 Nb 与 RBD 相互
              其更多变体广泛的中和潜力(图6B)。                                作用的结构,进一步阐明了它们中和 SARS⁃CoV⁃2
              2.7  Nb具有优越的理化特性                                  及其变体的机制。这一策略成功获得能够识别
                  为了测试 Nb 的物理稳定性,将 4 种 Nb 暴露在                   SARS⁃CoV⁃2 及其变体的广谱 Nb,并且这种方法广
              不同条件下,包括不同温度和 pH 值(图 7)。在 RT                      泛适用于防治不断变异的病毒,如流感病毒、艾滋
              和 40、60、80、90 和 95 ℃下孵育 10 min 后,4 种 Nb           病毒等。这项研究为推进多种病毒的疫苗以及诊
              均保持着良好的亲和力(图7A)。在37 ℃下,10 d内                      断方法的开发提供了新思路。
              4种Nb 活性保持在70%左右(图7B)。即使在95 ℃                           SARS⁃CoV⁃2 是一种单链阳性 RNA 病毒,属于
              孵育 2 h 后,4 种 Nb 的结合活性仍均>75%(图 7C)。                乙型冠状病毒属        [10-11] 。SARS⁃CoV⁃2 的刺突蛋白是
              另外,4种Nb的结合活性在环境酸碱度达到一定程                           一种三聚体跨膜蛋白,由2个功能亚基——S1和S2
              度后才会受到限制(图7D)。上述结果表明,这4种                          组成。S1 亚基,特别是其 RBD,通过与人血管紧张
              Nb是高度稳定的,它们的用途必将不会受限于临床                           素转换酶 2(angiotensin converting enzyme2,ACE2)
              运输和保存等。                                           结合,在促进病毒进入宿主细胞当中发挥着关键作
                                                                用 [12-13] 。因此,SARS⁃CoV⁃2 刺突蛋白,尤其是 RBD
              3  讨 论
                                                                结合域,是各类研究主要的抗原靶点,如开发检测
                  本研究利用 WT⁃RBD 免疫羊驼建立噬菌体文                       试剂盒、疫苗、中和抗体以及病毒抑制剂等。虽然
              库,随后通过Delta⁃RBD对文库进行筛选,诱导表达                       目前有诸多针对刺突蛋白特别是 RBD 的单克隆抗
              后获得了4株Nb,即Nb34、Nb42、Nb45、Nb48。实验                  体,但是 SARS⁃CoV⁃2 的不断变异提高了其免疫逃
              证明其与SARS⁃CoV⁃2及其变体具有良好的结合能                        逸能力,从而降低了这些抗体的中和能力                    [14-17] 。因
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