Page 124 - 《南京医科大学学报》2026年第1期
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第46卷第1期
              · 118  ·                           南 京    医 科 大 学 学         报                        2026年1月


              METTL18、SERPINC1、ZNF496、AC016683.6、PAX8、          中 rs34788973、rs61742093、rs13195509 的 CADD≥
              GLS、LARS2、NCKIPSD、QRICH1、AMT,图3E)。最显              12.37,距离 rs34788973、rs61742093 最近的基因为
              著的易感基因是SPATS2L(图3F)。作用于食管全层                       OR2B2;距 离 rs13195509 最 近 的 基 因 是 BTN2A1
              的易感基因及最显著的易感基因,都值得进一步探索。                         (表 3)。可见抑郁与 GERD、NERD 都与 BTN2A1 免
                                                                                          [13]
              2.7  抑郁与GERD、NERD共享基因的功能注释                        疫调节有关,与他人研究一致 。
                  抑郁与GERD功能注释中rs13195509、rs200287431、                通过MAGMA方法预测抑郁和GERD有关的生物
              rs1679709 等几个位点的 CADD≥12.37,提示对蛋                  学信号通路主要富集在DNA与RNA转录等方面(表
              白质功能有很强影响。距离 rs13195509 最近的                       4)。富集分析发现多效性基因大部分富集在脑组织
              基因为 BTN2A1(表 2)。抑郁与 NERD 功能注释                     中,其次为肝脏、胰腺等消化组织中。GO分析(图 4)

                                              表2 抑郁与GERD共享基因的功能注释
                               Table 2 Functional annotations of collaborating genes in depression and GERD
                                                                           2
                      SNP           CHR         POS          MAF         R          Nearest gene     CADD
                   rs13195509        6        26463660       0.083      0.693        BTN2A1          22.50
                   rs200287431       3        49761567       0.160      0.814         IP6K1          22.40
                   rs1679709         6        28228342       0.116      0.844         NKAPL          22.30
                   rs58339610        3        49845006       0.163      0.840         UBA7           18.12
                   rs940045          3        49449638       0.233      0.776      RHOA:TCTA         16.24
                   rs203888          6        28021589       0.201      0.821        OR2B8P          15.75
                   rs10484397        6        27405683       0.356      0.830         ZNF184         15.52
                   rs2393931         6        27353114       0.256      0.670         ZNF391         15.41
                   rs188105          6        28071393       0.253      0.724       ZSCAN12P1        15.23
                   rs7617480         3        49210732       0.212      1.000        KLHDC8B         15.13
                 CHR:chromsome;POS:position;MAF:minor allele frequency.
                                              表3 抑郁与NERD共享基因的功能注释
                               Table 3 Functional annotations of collaborating genes in depression and NERD
                                                                           2
                      SNP           CHR          POS          MAF         R         Nearest gene     CADD
                   rs34788973        6         27879200      0.074       0.785        OR2B2          23.20
                   rs61742093        6         27879982      0.074       0.785        OR2B2          22.60
                   rs13195509        6         26463660      0.083       0.693        BTN2A1         22.50
                   rs200287431       3         49761567      0.160       0.814         IP6K1         22.40
                   rs1679709         6         28228342      0.116       0.844        NKAPL          22.30
                   rs200973          6         27858421      0.146       0.696       HIST1H3J        21.50
                   rs35723519        1         52306063      0.454       0.947         NRD1          18.36
                   rs58339610        3         49845006      0.163       0.840         UBA7          18.12
                   rs11209943        1         72750500      0.359       0.991        NEGR1          17.85
                   rs736756          1         52344414      0.473       0.881         NRD1          17.34
                 CHR:chromsome;POS:position;MAF:minor allele frequency.
                                             表4   抑郁与GERD基因富集分析(MAGMA)
                                   Table 4 Gene enrichment analysis of depression and GERD(MAGMA)
                                         Gene set                             Gene(n)    Beta     SE       P
               DNA binding transcription factor activity                         6       2.453   0.838   0.003
               RNA polymerase Ⅱ transcription regulatory region sequence specific DNA binding  6  2.453  0.838  0.003
               Tumor differentiated well vs. moderately                          3       4.446   1.981   0.015
               Calorie restriction neocortex                                     2       4.222   1.921   0.017
               HDAC1 and HDAC2 targets                                           2       2.174   1.025   0.020
               Transcription regulator activity                                  8       1.145   0.589   0.030
               Bound by MYC                                                      2       5.609   3.161   0.042
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