Page 40 - 南京医科大学自然版
P. 40

第46卷第5期
              ·662 ·                             南 京    医 科 大 学 学         报                        2026年5月


                A                                                      B
                            HALLMARK_MTORC1_SIGNALING
                             HALLMARK_MYC_TARGETS_V1                         0.6        P=3.48×10 -10
                      HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB                       0.4
                                HALLMARK_P53_PATHWAY           NES        Running  enrichment score HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
                                                                 2.2         0.2
                  HALLMARK_INTERFERON_GAMMA_RESPONSE
                                                                 2.0
                                   HALLMARK_APOPTOSIS                        0.0
                                                                 1.8
                      HALLMARK_PI3K_AKT_MTOR_SIGNALING
                                                                 1.6
                          HALLMARK_TGF_BETA_SIGNALING
                       HALLMARK_IL6_JAK_STAT3_SIGNALING                       3 0
                                                    0  5  10 15           Ranked  list metric  -3
                                                       -lg(P)                -6
                                                                                     5 000  10 000  15 000
                                                                                         Gene rank
                    C    0.6          P < 0.001              D       ***       **  AGS  *        *
                         enrichment score HALLMARK_PI3K_AKT_MTOR_SIGNALING  800  0.6  20    20         NC
                       Running  0.2                            (TMM)  600  0.4     15       15
                         0.4
                                                                                                       OE
                         0.0
                                                                400
                       Ranked  list metric  -3 3 0             Gene expression  200 0  0.2  10 5 0  10 5 0

                                                                          0.0
                          -6
                                 5 000  10 000  15 000              PTPN6     HLA⁃A   HLA⁃B    HLA⁃C
                                     Gene rank
                E                                F                               G
                         siNC
                         siPTPN6⁃1                        NC                              NC
                         siPTPN6⁃2                        PTPN6⁃OE                   1.5  PTPN6⁃OE
                                  ***
                             ***
                    1.5  ***  ***  ***  **           2.5  ***  ***  ***              1.0
                        ***
                   Relative RNA levels  1.0         Relative RNA levels  1.5         Relative RNA levels  0.5
                                                     2.0
                                                     1.0
                    0.5
                     0                               0.5 0                             0 PD⁃L1 B7⁃H6  MICA  MICB TGF⁃B CD155
                       HLA⁃A  HLA⁃B  HLA⁃C HLA⁃E       HLA⁃A  HLA⁃B  HLA⁃C HLA⁃E
                 A:Gene set enrichment analysis(GSEA)of hallmark genes upregulated following PTPN6⁃OE(n=3). The X⁃axis indicates the -lg(P value)for
              each gene set. B:GSEA for the TNFA signaling via NF⁃κB gene set. C:GSEA for the PI3K⁃AKT⁃mTOR signaling gene set. D:mRNA expression levels
              of HLA class Ⅰ genes in PTPN6⁃OE and control AGS cells by RNA⁃seq(n=3). E:mRNA expression levels of HLA class Ⅰ genes in PTPN6⁃knockdown
              and control MKN1 cells(n=4). F:mRNA expression levels of HLA class Ⅰ genes in PTPN6⁃OE and control MKN1 cells(n=4). G:mRNA expression
                                                                                  **
                                                                            *
              levels of genes associated with NK cell dysfunction in PTPN6⁃OE and control MKN1 cells(n=4). P < 0.05,P < 0.01,and  *** P < 0.001.
                                         图6 PTPN6正向调控胃癌细胞HLA⁃Ⅰ类分子的表达
                       Figure 6 PTPN6 positively regulated the expression of HLA class Ⅰ molecules in gastric cancer cells

              本研究通过体外共培养体系和小鼠体内模型证实,                            HLA⁃A、HLA⁃B 和 HLA⁃C 的表达,这可能是其调控
              胃癌细胞中PTPN6 的表达负向调控NK细胞的杀伤                         NK 细胞功能的重要机制之一。本研究的局限性在
              活性及其在肿瘤组织中的浸润水平,进一步拓展了                            于,为广泛探索转录组变化而采用的 |log2FC|>0.25
              PTPN6在肿瘤免疫微环境调节中的作用。                              筛选标准可能引入假阳性,但关键结果已通过实验
                  NK 细胞作为机体抗肿瘤免疫的第一道防线,                         验证。此外,NK 细胞介导的杀伤作用影响因素很
              其杀伤活性受到细胞表面的活化型/抑制型受体与                            多,许多机制尚有待于深入研究。而PTPN6如何调
              靶细胞配体相互作用的精细调控。其中,靶细胞表                            控HLA⁃Ⅰ类分子表达的具体分子机制,也有待进一
              面 HLA⁃Ⅰ类分子是介导 NK 细胞功能抑制的关键                        步的实验加以阐明。
              分子。既往研究表明,耐药肿瘤细胞可通过上调                                  综上所述,本研究表明PTPN6在胃癌中呈现高
              HLA⁃Ⅰ类分子表达,从而逃避 NK 细胞介导的杀伤                        表达,且发挥着促癌作用。其表达水平与肿瘤组织
              作用  [25] 。本研究发现,胃癌细胞中PTPN6正向调控                    中 NK 细胞的浸润及活化水平呈负相关,推测可能
   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45