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第41卷第3期 倪 蓉,梁 健,赵 超,等. CNV⁃seq技术在自然流产遗传学诊断中的应用[J].
2021年3月 南京医科大学学报(自然科学版),2021,41(03):424-427 ·425 ·
变异数据库(detabase of genomic variants,DGV)以及 表1 染色体数目异常检出情况
在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheri⁃ 异常 例数 百分比 异常 例数 百分比
tance in man,OMIN)进行比对,分析 CNV 的临床意 类型 (%) 类型 (%)
义。此外利用 STR 技术对流产物母本外周血及流 16三体 10 27.1 7三体 01 002.7
45,X 09 24.3 12三体 01 002.7
产组织进行STR 分析,排除母源污染和三倍体及多
13三体 04 10.8 14三体 01 002.7
倍体的倍性分析。
18三体 04 10.8 15三体 01 002.7
2 结 果 2三体 02 05.4 21三体 01 002.7
20三体 02 05.4 合计 37 100.0
在112例流产样本中,染色体结果异常共56例 22三体 01 02.7
(50.0%,56/112)。在56例染色体异常结果中,染色
体数目异常 37 例(66.1%),染色体结构异常 12 例 体检测,除上述 1 例女方为平衡易位携带者外,其
(21.4%),嵌合体7例(12.5%)。 余 3 例夫妻双方外周血染色体检测结果均正常。
2.1 染色体数目异常 2.3 嵌合体
出 现 异 常 信 号 频 率 高 的 分 别 是 16 三 体 112 例流产物样本中,共检测出 7 例嵌合体,其
(27.1%)、45,X(24.3%)、13 三体(10.8%)、18 三体 中1例为70,XNN,+2[60%]/69,XNN[40%],为3倍
(10.8%)(表1)。 体嵌合体(表3)。
2.2 染色体结构异常 2.4 年龄因素
112例流产物样本中共检测出染色体结构异常 患者年龄≥35岁发生染色体异常导致的流产者
12 例,共发现 24 个 CNV,最小片段长度 0.24 Mb,最 占 63.2%,年龄<35 岁发生染色体异常导致的流产
大片段 58.90 Mb。在检测出的 24 个 CNV 中,18 个 者占 47.3%,虽然二者在统计学上无显著差异,但
CNV有临床意义。在检测出的致病性CNV中,发现 ≥35岁组的异常率比<35岁组高15.9%(表4)。
2 个包含微缺失\微重复综合征,即 Cridu chatsyn⁃
3 讨 论
drome 综合征和 Wolf⁃Hirschhorn Syndrome 综合征,
其中 Wolf⁃Hirschhorn Syndrome 综合征还伴有 12、 CNV⁃seq 基于二代测序技术对样本 DNA 进行
20 号染色体部分区域重复(表 2),经该夫妻双方知 全基因组测序(0.1X),测序结果与人类参考基因组
情同意后行外周血染色体检测,女方为平衡易位携 进行比对,通过生物信息学分析以发现受检样本可
带者[46,XX,t(4;12;20),图 1]。12 例流产物染色 能存在的染色体相关异常。染色体核型技术可以
体结构异常患者,其中 4 例夫妻双方行外周血染色 准确检测出自然流产或者胎儿的染色体数目或结
表2 染色体结构异常检出情况
异常类型 年龄 片段大小(Mb) 有无临床意义
*46,XN,del(4)(p16.3⁃p15.32),dup(12)(p13.31⁃p11.22), 26 15.64、21.74、17.28 有
dup(20)(q13.12⁃q13.33)
*46,XN,del(5)p(15.33p13.3),dup(5)p(13.3p13.2) 33 33.56、2.38 有
46,XN,dup(16)(p13.3q21)(q21q24.3) 39 58.90、23.88 有
*46,XN,del(14)(q32.13q32.33) 33 11.34 有
46,XN,del(15)(q25.2) 30 1.78 有
*46,XN,del(4)(q32.2q32.3)(mos),del(4)(q32.3q35.2),dup(12) 26 5.54、21.44、22.08、27.96 有
(q24.12q24.33)(mos),dup(16)(q21q24.3)(mos)
46,XN,del(8)(p23.3p23.2),dup(8)(p23.2),dup(8)(p23.2p23.1) 28 2.56、1.56、2.24 有
46,XN,del(X)(q23),dup(X)(q26.3) 30 0.23、0.38 有
46,XN,del(18)(p11.22p11.21) 33 1.08 无
dup(X)(p11.3p11.23),dup(11)(p11.12) 29 0.64、0.52 无
46,XN,dup(3)(q22.1),dup(8)(q24.23) 24 0.24、0.64 无
46,XN,dup(7)(q34) 28 0.36 无
*:为夫妻双方行外周血染色体检测。