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第42卷第8期
               ·1096 ·                           南 京    医 科 大 学 学         报                        2022年8月


              给目标蛋白质序列,运行ANNEX以提高GO注释准                          异蛋白,分析出19个蛋白在KEGG数据库中对应的
              确性。提取差异蛋白的GO Level2注释并进行分析                        多个信号通路。在差异蛋白通路富集结果中,依据
             (图 2)。结果显示,METH 引起与细胞生物学过程、                        显著性水平选取了 10 个产生明显改变的信号通路
              分子功能及细胞组分相关蛋白的改变。在细胞生                             (图 3),其中与突触相关的多个信号通路发生改变
              物学过程方面,细胞组分和生物合成、生物调节、免                           (红框表示),提示 METH 暴露对突触的调节通路的
              疫功能、神经代谢与发育、对外界作用的应答等过                            改变。
              程尤为明显;在分子功能方面,主要涉及转运、催
                                                                                                   ⁃lg(P_Value)
              化、分子传递等活性及蛋白结合过程的改变;在细                                                             0  1  2  3  4  5
              胞组分的改变中,涉及大分子蛋白、细胞膜、细胞器                                             Ovarian steroidogenesis
                                                                             Cortisol synthesis and secretion
              及突触等相关蛋白的改变。                                                           Cushing syndrome
                                                                                    GABAergic synapse
                                                                                     Mitophagy⁃animal
                                                                Parathyroid hormone synthesis,secretion and action
                 Biological process  Molecular function  Cellular component
                                                                          Aldosterone synthesis and secretion
                                            The number of proteins
                                                                                         Necroptosis
                                           0  10 20 30 40 50
                                                                                          Melanoma
              cellular component organization or biogenesis                       Glutamatergic synapse
                               nitrogen utilization
                              biological regulation                 横坐标为通路改变的P值,纵坐标为排名前10的功能学信号通
                                    localization
                                                                路,依次为卵巢类固醇生成,皮质醇合成与分泌,库欣综合征,GABA
                      multicellular organismal process
                                    locomotion                  能突触,线粒体自噬,甲状旁腺激素的合成、分泌及作用,醛固酮合
                               biological adhesion
                                     signaling                  成和分泌,程序性坏死,黑色素瘤,谷氨酸能突触等信号。
                         cell population proliferation                         图3 KEGG通路富集
                                   pigmentation
                                 cellular process                       Figure 3 KEGG pathway enrichment
                                     behavior
                                       growth
                              reproductiv process                    METH暴露引起原代神经元突触表达的改变
                            immune system process               2.4
                                rhythmic process                     突触是评价神经元生理功能的重要指标,在脑
                              response to stimulus
                                metabolic process               学习记忆,情绪及精神作用方面极为重要。 基于上
                            multi⁃organism process
                             developmental process              述蛋白组学研究发现,METH 暴露引起多种突触功
                               rtansporter activity
                        transcription regulator activity        能的改变(GABA 能及谷氨酸能突触,图3红框),以
                          structural molecule activity
                                                                及细胞成分突触及突触部分的作用(图 2 红框),我
                             cargo receptor activity
                                catalytic activity
                                                                们验证了 METH 作用后对突触的影响,观察了突触
                        molecular transducer activity
                                      binding
                         molecular function regulator           前,突触后及棘突标志性蛋白的表达。与蛋白组学
                          protein⁃containing complex
                            extracellular region part           中 METH 影响突触的结果一致,METH 作用于神经
                           supramolecular complex
                                    membrane                    元后引发棘突标志性蛋白 Drebrin 及突触后标志性
                                     nucleoid
                                  organelle part                蛋白PSD95表达的下调(图4),与对照组比,具有显
                                   cell junction
                                     organelle                  著性差异(P < 0.05)。此外,METH作用引起突触前
                                 membrane part
                                      synapse                   标志物 Synapsin 1 的上调,上述结果提示,METH 暴
                               extracellular region
                                      cell part                 露引起突触数量的改变,而对于突触后存在明显的
                          membrane⁃enclosed lumen
                                   synapse part                 损伤作用。
                                                                2.5  METH对树突、棘突表达及定位的影响
                                           0  20 40 60 80 100
                                           Percentage of proteins(%)  为进一步验证蛋白组学中METH对突触的作用
                 纵坐标表示有差异蛋白的类别,主横坐标表示差异蛋白个数,
                                                                及阐述 METH 暴露引起的原代神经元树突、棘突的
              副横坐标为该类别下差异蛋白占所有差异蛋白的比例。
                        图2   GO注释结果的Level 2统计                   影响,我们借助免疫荧光法,利用抗 F⁃actin 及 Dre⁃
                 Figure 2  Level 2 Statistics of GO annotation results  brin抗体分别标记神经元的树突及棘突。结果显示
                                                                (图5),对照组中树突与棘突存在大量的共定位,树
              2.3  KEGG通路富集分析                                   突上棘突数量丰富,而 METH(900 μmol/L)作用神
                  KEGG通路富集分析是蛋白质组学分析细胞功                         经元 24 h 后,棘突数量及荧光强度明显下降,同时
              能改变的重要方法。该研究中,基于实验中51个差                           与树突的共定位亦显著降低,提示 METH 暴露后可
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