Page 68 - 《南京医科大学学报》2026年第1期
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第46卷第1期
· 62 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2026年1月
物,电泳图上显示这些突变可能完全导致外显子 4 2.4 Sanger测序揭示特异性剪接模式
的跳跃(258 bp),证实了剪接位点突变对pre⁃mRNA 为精确解析突变诱导的异常剪接模式,本研究
剪接模式的显著影响(图3B)。 对PCR扩增产物进行纯化并克隆至pMD18⁃T载体,
A
c.391+2T>A/C
c.278⁃2A>T c.391+5G>A/delG
c.391+1G>T/A/C/ins T
c.278⁃3A>G c.278⁃1G>T/C/A c.391delG c.391+7A>G
Intron 3 Exon 4 Intron 4
440 bp 446 bp
XhoⅠ 114 bp BamHⅠ
Intron 3 Intron 4
SD6 SA2
Splice donor MCS Splice accepter
pSPL3 plasmid
SV40 promoter Amp gene SV40 LPAS
B
Acceptor site Donor site
c.391+1G>A
c.391+5delG
c.391+7A>G
c.391+2T>A
c.391+1insT
c.278⁃1G>C
c.278⁃2A>T
c.391delG
PSPL3 c.278⁃1G>T c.278⁃1G>A c.278⁃3A>G c.391+1G>T c.391+1G>C c.391+2T>C c.391+5G>A
bp M WT
2 000
1 000
750
500
372 bp SD Exon 4 SA Normal splicing
250 258 bp
SD SA Exon 4 skipping
100
A:Schematic diagram of minigene splicing detection vector and target variants. SD6 and SA2 are amplification primers,and arrows indicate PCR
amplification directions. The position of the site⁃directed variant is shown above. B:Agarose gel electrophoresis of in vitro splicing assays for exon 4.
The pSPL3 vector was used as a negative control,and its splicing product did not contain exon 4. The WT vector served as a positive control,and its ma⁃
ture transcript contained exon 4,showing normal splicing.
图3 突变对pre⁃mRNA剪接的影响
Figure 3 Effects of variants on pre⁃mRNA splicing
经转化、菌落PCR 筛选后进行Sanger 测序检验。结 c.391delG和c.391+1insT虽然破坏了经典剪接位点,
果显示,除外显子4跳跃外,还鉴定出另外两种异常 但是相对内含子来说仍然遵从原有切割位点,提
剪接转录本:①外显子4末端缺失96 nt的异常剪接 示-1G在剪接调控中的作用有限,剪接体主要识别供
转录本;②内含子 3 受体端 2 nt 保留的异常剪接转 体位点的内含子序列。c.391+5G>A和c.391+5delG
录本(图 4A)。深入分析表明,c.278⁃1G>T、c.278⁃ 作为内含子低保守性位点突变,同样导致外显子跳
1G>C、c.278⁃1G>A和c.278⁃2A>T突变通过破坏经典 跃,证明了非保守位点的突变对剪接调控的重要影
剪接供体位点导致外显子4跳跃,同时激活外显子4 响 。 其 余 5 个 突 变(c.391 + 1G>T、c.391 + 1G>A、
内的隐性剪接供体位点,产生部分外显子 4 末端缺 c.391+1G>C、c.391+2T>A、c.391+2T>C)均通过破坏
失96 nt的转录本。值得注意的是,c.278⁃3A>G突变 内含子保守位点导致外显子 4 跳跃。值得注意的
导致内含子3受体端2 nt的保留,形成移码突变,其 是,c.391+7A>G是唯一未影响剪接的突变,提示该位
机制可能与 c.278⁃3A>G 突变后与-4 位 A 组成受体 点相对较高的保守性可能与其功能冗余有关。通过
端高保守性“AG”序列有关。对于供体端突变, 对比这些突变的体外剪接模式与预测结果(表4),发

